尤琪
摘 ? 要:伴隨社會科技的不斷發展,在人類基因組計劃、遺傳語言、生物大分子功能與結構等研究取得成果下,從20世紀80年代末開始生物信息學已經成為了生物科學中一門新興學科,對各界人士在生物領域的工作研究有著重要作用。本次研究將對生物信息學基本概念、目前教學存在的問題進行分析,并提出了創新教學模式具體實踐方法。
關鍵詞:生物信息學 ?創新教學 ?實踐方法
中圖分類號:G642 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?文獻標識碼:A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?文章編號:1674-098X(2019)10(b)-0187-02
作為生物學科重要組成部分,生物信息學是生物學研究以及學習生物的科研人員、教師以及學生的重要工具。作為一門全新并具有極大發展潛力的前沿學科,生物信息學創設條件還不夠成熟,在師資力量、教學模式以及教學方法等方面存在一定問題,制約著學生學習生物成效。因此,本文對生物信息學創新教學模式的研究,有十分重要的現實意義。
1 ?生物信息學基本概念
生物信息學作為一門新興學科,主要是生物學、數學以及計算機科學之間進行相互結合發展而成。其主要是通過信息科學與計算機等方式,進而完成數據分析、數據處理,探索海量數據間內在關系以及生物學涵義,從而達到提煉具有價值生物學知識的目的[1]。
2 ?生物信息學教學現狀
2.1 師資力量匱乏
師資力量是衡量一門學科發展水平的關鍵,而當前生物信息教學,沒有一個完善的師資隊伍,滿足不了我國生物信息學發展需求,同時教師教學水平達不到生物信息學教學要求標準。
2.2 缺乏人才培養
在生物信息學專業人才培養方面,不同教師不同教學經驗,對人才培養方式也不盡相同,導致生物課程體系不符合學生實際需求,從而直接影響學生實踐能力和探究能力,很大程度上制約了我國當前綜合能力人才的培養[2]。
2.3 欠缺學科互通
從目前學科設置上看,生物學科和其他專業缺乏有效的結合和互動。生物信息學科雖然是新興學科,但是和其他學科之間仍然存在一定聯系,不同學科教師之間缺乏相互交流和合作,使得生物教學現狀不樂觀。
2.4 教學理念陳舊
受傳統教學觀念根深蒂固影響,教師通常只是重視知識灌輸,完成教學計劃,缺乏對學生能力以及素質等方面的培養。值得注意的是,任何教學中都不能忽視理論與實踐結合,否則單調的教學內容會使得學生失去學習興趣,不利于培養學生實踐能力。
2.5 教材配置不完善
所有教學都要依據教材進行,當今生物信息學教育快速發展,但是并不具備合適的理論和實驗教材,現階段主要應用的是國外原版教材以及翻譯書籍,我國學者自行研究制定的書籍少之又少[3]。
3 ?生物信息學創新教學模式具體實踐方法
3.1 明確生物信息學教學目標
在不同學科教學活動中,教師和學生角色定位就不同,在一些教學活動中,教師是主角,學生是配角,而有一些教學活動,二者角色就要相互轉換,主要是依據教學內容,根據實際情況進行靈活掌握。生物信息學是多學科之間交叉而生的產物,涵蓋內容較為復雜廣泛,因此,如果讓學生獨立自主學習,會帶來一定難度。特別是生物信息學中有關數學知識方面,如隱馬爾科夫鏈、動態規劃算法等等,在教學中需要教師做主導角色進行講授。
由于課堂時間受限,利用探究式教學模式,讓學生充分利用課余時間繼續拓展知識。如玉米基因組SSR引物設計,對于這種問題,通常無法得到直接答案,需要學生自己查找相關數據庫而后進行總結分析。然后對學生實行隨機分組制,通過小組合作方式去搜索相關基因和蛋白質數據庫。針對具體問題進行討論,最后教師總結分析,對學生學習情況進行點評,并給出適當合理建議。
3.2 理論與實踐充分結合
3.2.1 有效利用生物數據庫,提高學生處理能力
生物信息學教師讓學生利用生物數據庫,提高學生對生物信息處理能力,在大型服務器和計算機參與下,大大提高了生物分子研究工作效率。目前,生物數據庫總數已經達到500個以上,蛋白質以及其他生物大分子結構,蛋白質結構分類,數據庫通過網絡為其提供多種形式數據檢索服務。
3.2.2 開發序列比對軟件,增強學生動手能力
開發序列比對軟件,可以增強學生利用生物信息處理軟件能力。通過比較,把未知序列和數據庫中已知數列進行對比,這是一種有效的研究方式。可以實現2個物種全基因組序列對比工作,進行序列比對比主要目標是通過判斷2個序列之間是否有充足相關性,進而判斷二者是否存在同源性關系。在實驗教學中,通過培訓序列比對軟件開發,使得學生更好地使用生物信息處理軟件,同時也能解決其他軟件問題。
3.2.3 合理運用生物信息學,提高學生思考能力
教師在實踐教學中結合相關生物信息學相關知識,增強學生思考能力,提高蛋白質信息獲取能力。因為構成蛋白質的20種氨基酸化學構造上與構成核算的4種堿基差別相差甚遠,所以無論是蛋白質結構還是功能,都具多樣性。目前,對蛋白質結構信息獲取工作還需耗費大量時間,對技術和技巧提出了更高要求。由于蛋白質結構和功能的復雜,需要通過生物信息學相關技術方法對其解釋,充分利用生物信息學知識,促使學生更好更快掌握蛋白質信息。
3.2.4 利用網絡平臺,優化實驗教學
當今是高技術信息時代,教師應當充分利用網絡平臺,發揮其優勢,實現優化實驗教學目的。所謂生物信息學實驗教學,主要是通過對大量生物數據進行處理、分析出實際需求,進而培養學生運用生物信息學相關知識和方法,具有生物信息提取、存儲、處理以及分析能力,促使學生形成獨立思考和獨立分析能力,并將理論知識運用到解決實際問題中。生物信息學教學應根據學生掌握情況逐漸增加難度,把典型的生物學問題進行實驗設計,調動學生積極主動性和探索精神,激發學生學習能力以及創新能力。
生物信息學實驗教學利用互動網平臺,把計算機作為輔助工具,在計算機網絡實驗室內完成。把課程知識與網絡有效結合,通過電子郵件與學生之間建立交流,將教學內容、工具等傳遞給學生,此外,學生也可通過這種方式將實驗報告、作業以及各種問題和意見反饋給教師,利用網絡時效性,實現了教師和學生相之間雙贏的目的。
3.2.5 加強實踐考核,強化學生綜合能力
生物信息學主要目的是學習運用互聯網。計算機以及其他應用軟件,掌握分析生物信息理論和方法。因此,通過上機實際操作著重考核學生在互聯網作用下,分析生物信息以及解釋結果的能力,考察學生生物信息學基本知識和基本原理的掌握程度,同時也考核學生生物信息分析和實際應用能力。通過實踐考核,進一步提升學生將理論用于實踐中的綜合能力。
4 ?結語
總而言之,生物信息學作為一門全新學科。教師要了解當前生物信息學現狀,明確教學目標,以生物信息學知識為主體,充分將理論知識和實踐教學結合。通過數據庫的使用、開發序列比對軟件、利用網絡平臺優化實驗教學、加強實考核等方法,調動學生主觀能動性,發揮探索精神,提高學生實際操作能力,進一步提升學生綜合能力以及創新精神。
參考文獻
[1] 朱柳村,李嘉睿.生物信息學創新教學模式的探究[J].安徽農學通報,2017(6):185-187.
[2] 胡楊.《生物信息學》課程教學模式探討[J].生物信息學, 2018,16(2):10-13.
[3] 羅曉霞,夏占峰,王建明.生物信息學課程“教研一體化”教學模式初探[J].教育現代化,2017,4(52):57-59.