鐵死亡通路關(guān)鍵基因在肝癌中的表達(dá)及臨床意義

王曉 張凌云

原發(fā)性肝癌是世界范圍內(nèi)癌癥相關(guān)的主要致死病因之一[1]。目前手術(shù)是早期肝癌的有效治療手段,但大部分患者確診時(shí)已經(jīng)是中晚期[2]。雖然凋亡相關(guān)的治療方法取得一定的效果,但是仍然達(dá)不到臨床期望療效[3]。鐵死亡是新近發(fā)現(xiàn)的一種鐵離子依賴的程序性細(xì)胞死亡方式。癌細(xì)胞表現(xiàn)出的代謝特點(diǎn)和對(duì)鐵的依賴性使鐵死亡誘導(dǎo)劑治療腫瘤成為可能,促進(jìn)鐵死亡的發(fā)生可有效干預(yù)腫瘤進(jìn)展[4-6]。鐵死亡過(guò)程中伴隨著細(xì)胞內(nèi)大量鐵離子的累積、谷胱甘肽消耗、脂質(zhì)過(guò)氧化及脂質(zhì)活性氧的產(chǎn)生。鐵離子、氨基酸代謝及脂質(zhì)過(guò)氧化等相關(guān)的信號(hào)通路影響鐵死亡的發(fā)生[7, 8]。谷胱甘肽過(guò)氧化物酶 4(glutathione peroxidase 4,GPX4)、 溶質(zhì)載體家族7成員11(solute carrier family 7 member 11,SLC7A11)、線粒體相關(guān)凋亡誘導(dǎo)因子2(apoptosis-inducing factor mitochondria-associated 2,AIFM2)、長(zhǎng)鏈脂酰輔酶A合成酶4(acyl-CoA synthetase long-chain family member 4,ACSL4)、核因子紅細(xì)胞2相關(guān)因子2(nuclear factor erythroid 2-related factor 2,Nrf2)是鐵死亡通路的關(guān)鍵調(diào)控基因[4, 6, 9]。本研究運(yùn)用生物信息學(xué)分析鐵死亡通路關(guān)鍵基因在肝癌中的表達(dá),以及其與臨床預(yù)后、免疫調(diào)控的關(guān)系,為進(jìn)一步優(yōu)化肝癌的治療方案及鐵死亡的臨床應(yīng)用提供理論依據(jù)。

資料與方法

一、基因表達(dá)水平分析

運(yùn)用在線數(shù)據(jù)庫(kù)(http://gepia.cancer-pku.cn)對(duì)鐵死亡通路關(guān)鍵基因在人肝癌組織及正常肝組織中的mRNA表達(dá)水平進(jìn)行對(duì)比分析。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

二、基因改變頻率分析

采用cBioPortal數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.cbioportal.org)分析肝癌患者鐵死亡通路關(guān)鍵基因改變的情況。

三、預(yù)后分析

采用在線工具Kaplan-Meier生存曲線(http://www.kmplot.com)和GEPIA數(shù)據(jù)庫(kù)評(píng)估鐵死亡通路關(guān)鍵基因表達(dá)水平的預(yù)后價(jià)值。

四、免疫浸潤(rùn)細(xì)胞分析

TIMER(https://cistrome.shinyapps.io/timer/)在線數(shù)據(jù)庫(kù)分析肝癌患者鐵死亡通路關(guān)鍵基因與免疫細(xì)胞數(shù)量的相關(guān)性。……