基于數(shù)據(jù)庫挖掘分析TEAD2 在膠質瘤診斷和治療中的作用

雷蓉，李珣，賀詩施，聶燕

膠質瘤是常見的顱內(nèi)原發(fā)惡性腫瘤，其中惡性程度最高的為膠質母細胞瘤（WHO IV），其發(fā)病率約為3/1 000 000［1］。在經(jīng)過手術標準治療后，其中位生存時間仍不到1 年［2］，聯(lián)合替莫唑胺化療中位無進展生存期為4.0個月，中位總生存期為16個月，在維持替莫唑胺化療中的基礎上加入腫瘤治療電場（TTFields）治療后可改善預后，其中位無進展生存期比單獨使用替莫唑胺提高2.7 個月，中位總生存期提高4.9 個月［3］。這些數(shù)據(jù)表明腦膠質瘤預后不良，嚴重威脅患者生命，迫切需要新的治療方法。

TEAD2 是TEAD（transcriptional enhanced associate domain，轉錄增強關聯(lián)結構域）轉錄因子家族成員之一，是HIPPO 信號通路的主要轉錄因子，其在神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育過程中發(fā)揮著重要作用［4］。TEAD2通過調(diào)控PAX3的表達調(diào)節(jié)神經(jīng)嵴細胞遷移和細胞分化，同時，TEAD2 在神經(jīng)元增殖過程中也發(fā)揮著關鍵作用［5］。在腫瘤的進展過程中，TEAD2與E2A 結合抑制乙酰輔酶A 合成以促進腫瘤發(fā)生［6］；與YAP 結合促進上皮間質轉化過程，從而促進腫瘤轉移［7］。因此，考慮到TEAD2在神經(jīng)系統(tǒng)和在腫瘤中的作用，我們推測TEAD2可能促進了膠質瘤的發(fā)生發(fā)展。為揭示其在膠質瘤中的作用，我們通過生物信息學，挖掘公共數(shù)據(jù)庫，探討了TEAD2表達模式及臨床病理意義，為進一步研究TEAD2在膠質瘤的作用提供新的思路和理論依據(jù)。

1 資料和方法

1.1 數(shù)據(jù)庫和數(shù)據(jù)處理

泛癌中基因差異表達數(shù)據(jù)來源于Timer2.0 數(shù)據(jù)庫（http：//timer.comp-genomics.org/）、UCSC 數(shù)據(jù)庫（https：//xenabrowser.net/），每個腫瘤細胞系的表達數(shù)據(jù)從CCLE 數(shù)據(jù)庫（https：//portals.broadinstitute.org/）下載。并收集了CGGA 和TCGA 數(shù)據(jù)庫中低級別膠質瘤（LGG）和GBM 樣本的表達數(shù)據(jù)和相應的臨床數(shù)據(jù)。……