大腸埃希菌臨床株QD24對黏菌素和碳青霉烯類耐藥的機制

王曉慧,賈 楠,王 笑 ,2,姜美妍,朱元祺,2*

(1.青島大學附屬醫院,山東 青島266003;2.青島大學醫學部,山東 青島266071; 3.淄博市張店區人民醫院,山東 淄博266034)

新德里金屬-β-內酰胺酶(NDM)是最常見的碳青霉烯酶,除了氨曲南外,對幾乎所有的β-內酰胺類抗生素具有水解作用。目前,包括blaNDM-1到blaNDM-48(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pathogens/refgene/#NDM)在內的48個基因變體編碼NDM酶[1]。其中,blaNDM-13基因于2015年由Shrestha首次報道[2]。黏菌素是治療碳青霉烯耐藥細菌引起的感染的最后手段[3]。然而,質粒介導的黏菌素耐藥基因mcr-1的出現引起了廣泛關注[4]。一旦mcr-1和blaNDM-13共存,這將威脅到碳青霉烯類耐藥菌的抗感染治療,但目前尚無同時攜帶這兩個基因的病原體的報道。因此,本文是對同時攜帶mcr-1.1和blaNDM-13耐藥基因的ST69型大腸埃希菌臨床分離株進行研究,現報道如下。

1 材料與方法

1.1 菌株大腸埃希菌臨床株QD24分離于2019年住院尿路感染患者的尿標本。脈沖場凝膠電泳的分子量標記為沙門菌H9812;儀器質控菌株為ATCC 25922和ATCC 700603;疊氮鈉耐藥大腸埃希菌J53AziR為質粒液相接合受體菌(E.coliJ53AziR)。以上菌株均為本實驗室保存。

1.2 儀器和試劑細菌鑒定和藥敏為VITEK 2 Compact 全自動系統,結果判定按照CLSI-M100-2021[5];碳青霉烯酶檢測卡為北京金山川公司生產;凝膠成像儀和脈沖場電泳(PFGE)系統為BIO-RAD公司。

1.3 S1核酸脈沖場凝膠電泳和Xba I脈沖場凝膠電泳具體操作步驟和結果解釋依據相關文獻報道的方法[6-7]。

1.4 液相接合試驗大腸埃希菌臨床株QD24與E.coliJ53AziR的液相接合操作步驟參照相關文獻進行[6]。

1.5 大腸埃希菌臨床株QD24的全基因組測序采用二代Illumina和三代Nanopore測序平臺以獲得QD24株的染色體和質粒序列,然后利用在線軟件,如ResFinder(4.1)和PlasmidFinder(2.1)等,分析該菌株的生物學信息。……