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堿性亮氨酸拉鏈ATF樣轉錄因子在腎透明細胞癌預后和免疫浸潤細胞中的潛在價值

2022-12-19 07:53:08趙瑩瑩何心輝張麗鄭彩云姜勇
臨床外科雜志 2022年11期
關鍵詞:數據庫水平

趙瑩瑩 何心輝 張麗 鄭彩云 姜勇

腎細胞癌是泌尿系統常見的惡性腫瘤。2020年全球范圍內約有43萬例新發病例和14萬死亡病例[1]。腎透明細胞癌(kidney renal clear cell carcinoma,KIRC)為腎癌的主要亞型,占所有病例的75%,是泌尿系惡性程度最高的腫瘤之一,也是泌尿生殖系統腫瘤中死亡率最高的腫瘤[2]。KIRC具有復雜的生物學特征,對放化療不敏感;手術是治療KIRC的主要方法[3],但20%~40%的病人在術后出現局部復發或遠處轉移,5年生存率約為20%~30%[4]。分子靶向治療和免疫治療能改善KIRC病人的預后,但潛在的分子機制及治療靶點仍有待進一步研究。堿性亮氨酸拉鏈ATF樣轉錄因子(the basic leucine zipper ATF-like transcription factor,BATF)位于人類染色體14q24.3上,轉錄本為NM_006399[5],編碼堿性亮氨酸拉鏈蛋白,隸屬于激活轉錄因子(Activating transcription factor,AP-1/ATF)超家族。近年來研究表明,BATF在樹突狀細胞、B細胞和T細胞的轉錄中起著積極的調控作用[6-7]。此外,BATF 在癌癥中存在異常表達,參與癌癥進展[8-11]。BATF在間變性大細胞淋巴瘤和肺癌組織中的表達水平增高[8-9]。敲除BATF會導致癌細胞生長停滯、凋亡加速,表明BATF可能在調控腫瘤細胞增殖和凋亡中起重要作用。本研究擬利用UALCAN、TISIDB、Kaplan-Meier plotter、OncoLnc及Sangerbox數據庫數據庫分析BATF在KIRC組織中的表達水平,探究BATF及甲基化水平與病人預后和臨床病理學特征之間的關系,并分析BATF表達與腫瘤免疫浸潤細胞及標志物水平的關系。

資料與方法

1.UALCAN(http://ualcan.path.uab.edu)數據庫:是對TCGA基因表達數據進行深層次分析的公開數據庫[12]。我們分析了BATF在各種類型癌癥中的表達水平,包括在KIRC和正常樣本的表達水平,及與KIRC臨床病理學特征(腫瘤分級、腫瘤分期、淋巴結轉移等)和預后之間的關系。……

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