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基于生物信息學的子宮內膜癌診斷標志物的篩選及免疫細胞浸潤分析

2020-12-24 07:09:22阿說阿牛曲木金作伍秋紅涼山州婦幼保健計劃生育服務中心婦產科涼山615000
中國免疫學雜志 2020年22期
關鍵詞:信號分析研究

阿說阿牛 孫 麗 曲木金作 伍秋紅 (涼山州婦幼保健計劃生育服務中心婦產科,涼山 615000)

子宮內膜癌(endometrial carcinoma,EC)是常見的婦科惡性腫瘤之一[1]。由于人口老齡化和肥胖率上升,全球范圍內EC的發病率和死亡率呈上升趨勢[2]。目前,EC的早期診斷通常基于患者臨床表現,如絕經后出血或某些腫瘤標志物的血清水平異常,而約15%的EC發生于無陰道出血的女性[3]。有研究報道了不同的血清學標志物在EC診斷中的作用,如癌胚抗原、碳水化合物抗原-125和碳水化合物抗原19-9,但其僅在20%~30%的EC患者中表達上調[3,4]。由于診斷不及時,EC患者往往失去了最佳治療時機,導致腫瘤轉移及術后復發的風險較高,預后較差[5,6]。因此,迫切需要尋找更可靠和前瞻性更強的診斷生物標志物以提高EC患者的生存率。越來越多的證據表明,腫瘤免疫細胞浸潤與癌癥的發生發展密切相關[7-9]。腫瘤中免疫細胞浸潤的類型和比例與臨床結果密切相關,其不僅對患者的生存具有預測價值,還可影響腫瘤治療效果,因此有望成為藥物靶標及臨床生物標志物[10,11]。腫瘤相關中性粒細胞是免疫細胞的主要類型,可消除病原體并防止宿主受到微生物感染,且與乳腺癌和胃癌的預后相關[12-14]。此外,腫瘤相關巨噬細胞參與EC的侵襲性進展,可作為EC的潛在治療靶標[15,16]。本研究從GEO和TCGA數據庫下載EC的表達譜數據集,利用R軟件鑒定差異表達基因(differentially expressed genes,DEGs),并對DEGs進行功能和通路富集分析[17,18]。構建蛋白質-蛋白質相互作用(protein-protein interaction,PPI)網絡并選擇關鍵(hub)基因,通過繪制ROC曲線對hub基因進行診斷價值分析,進而篩選出EC的診斷生物標志物。……

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