采用基因表達數據集分析UBE2C與膀胱癌臨床病理特征和預后的相關性

翁 鴻，曾憲濤，黃 橋，高群竣，王行環

(1.武漢大學中南醫院泌尿外科，湖北武漢 430071；2.武漢大學中南醫院循證與轉化醫學中心，湖北武漢 430071；3.武漢大學循證與轉化醫學中心，湖北武漢 430071；4.深圳市第二人民醫院醫學重編程技術重點實驗室，廣東深圳 518035；5.深圳市第二人民醫院泌尿外科，廣東深圳 518035)

膀胱癌是常見惡性腫瘤之一，男性發病率高于女性，據世界癌癥研究機構2012年的全球癌癥統計數據顯示，男性中膀胱癌發病率排第6位，死亡率占第9位[1]。已有大量研究顯示，吸煙、飲酒、職業暴露、肥胖、體育活動、大氣污染等是膀胱癌發病的危險因素[2-7]。近年來，我國人群生活方式發生改變，肥胖率增加，尤其是男性吸煙、飲酒率較高，可能是膀胱癌發病率上升的影響因素。因此，尋找膀胱癌驅動基因、早期診斷標志物、預后標志物及可能的治療靶點是亟待解決的重要工作。隨著轉化醫學和精準醫學的發展，膀胱癌基因組學數據越來越多。因此，本團隊從Oncomine數據庫中篩選出肌層浸潤性膀胱癌與癌旁組織的基因表達譜數據并進行整合分析，將表達差異最顯著的基因進行后續分析，旨在尋找膀胱癌發生發展的驅動基因及可能的診斷及預后標志物和潛在的治療靶點。

1 材料與方法

1.1實驗材料通過Oncomine數據庫(https://www.oncomine.org)篩選出肌層浸潤性膀胱癌與癌旁組織的基因表達譜數據(6個子數據集)，然后進行整合分析，篩選出表達差異最顯著的基因進行后續分析。然后通過基因表達譜數據庫(GEO，https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)下載膀胱癌基因表達譜數據集GSE13507的基因表達矩陣數據及其臨床病理特征數據集[8-9]，用來分析Oncomine中篩選出來的表達差異最顯著的基因與膀胱癌臨床病理特征和預后的關系，并分析其診斷效能。……