二代測(cè)序法深度分析水痘疫苗Oka株病毒基因特征

王月紅，張賽，吳根鵬，王亮，朱為

上海生物制品研究所有限責(zé)任公司, 上海 200051

水痘-帶狀皰疹病毒(varicella-zoster virus，VZV)屬皰疹病毒科α皰疹病毒亞科，人是其唯一宿主，初次感染后發(fā)生水痘。VZV具有嗜神經(jīng)性，初次感染期間，可沿感覺(jué)神經(jīng)上行，潛伏在背根和三叉神經(jīng)節(jié)；當(dāng)免疫力下降或在其他誘因下，可再次激活引起帶狀皰疹。日本學(xué)者Takahashi采用人胚肺成纖維細(xì)胞分離VZV Oka株，在人胚肺成纖維細(xì)胞、豚鼠胚成纖維細(xì)胞、人二倍體細(xì)胞WI-38和MRC-5中連續(xù)傳代，建立了VZV Oka疫苗株(vOka)。全球各地廣泛使用vOka株生產(chǎn)水痘疫苗，并用該毒株研制和生產(chǎn)帶狀皰疹疫苗，顯示了良好的安全性和有效性[1-4]。用于生產(chǎn)疫苗的vOka株未經(jīng)克隆純化，含有許多不同的單基因型病毒。早期的Sanger法測(cè)序顯示，vOka株與親本株(pOka)之間至少存在42個(gè)位點(diǎn)的差異，除少數(shù)幾個(gè)位點(diǎn)突變?yōu)橐呙缧屯猓蟛糠治稽c(diǎn)為親本型與疫苗型并存[5]。這些位點(diǎn)通常稱(chēng)為單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism，SNP)位點(diǎn)。隨著研究的深入和測(cè)序技術(shù)的進(jìn)步，更多關(guān)于各疫苗公司的Oka株病毒序列和SNP位點(diǎn)信息被報(bào)道。由于各疫苗公司毒種來(lái)源、建庫(kù)方式、細(xì)胞基質(zhì)及生產(chǎn)工藝等各不相同，疫苗病毒序列雖然非常相似，但仍存在一定的差異，不同批次之間也有差異[6-9]。本研究采用二代測(cè)序(next-generation sequencing，NGS)技術(shù)，對(duì)上海生物制品研究所有限責(zé)任公司(以下簡(jiǎn)稱(chēng)SIBP)不同年度生產(chǎn)的水痘疫苗進(jìn)行病毒全基因組測(cè)序，分析疫苗質(zhì)量的一致性，并與日本大阪大學(xué)微生物病研究會(huì)(BIKEN)vOka毒種及不同廠家疫苗病毒序列進(jìn)行相關(guān)性比較。……