胡 彤, 徐麗娟, 顧卓然, 龐 智
1.南京醫科大學附屬蘇州醫院(北區)消化內科,江蘇 蘇州215008; 2.中國醫科大學臨床醫學系
環狀RNA(circular RNA,circRNA)是一類新型的內源性非編碼RNA。與線性RNA不同,circRNA是通過共價鍵形成不具有5′末端帽子及3′末端的閉合環狀結構[1]。SANGER等[2]于1976年首次在植物病毒中發現circRNA,但其一直被認為是轉錄本異常剪接形成的中間產物或錯誤產物,未引起廣泛關注。隨著生物信息學和高通量測序技術的快速發展,研究[3]發現,circRNA廣泛存在于真核細胞中,具有多種生物學功能,可能在多種疾病的發生、發展中起著重要作用,因而近年來逐漸成為RNA領域的研究熱點。本文就circRNA在消化系統疾病中的研究進展作一概述。
circRNA主要來源于蛋白質編碼基因,也可由基因區間、反義轉錄本、tRNA及lncRNA等產生[4-5]。目前其產生機制和過程尚未徹底明確。研究[6]顯示,不同于線性RNA,circRNA通過反向剪接將下游的剪接位點與上游的剪接位點反向連接,形成共價閉合的環狀結構。目前根據其來源及構成序列不同分為3類:外顯子circRNA(ecircRNA)、內含子circRNA(ciRNA)及由外顯子和內含子共同形成的circRNA(ElciRNA)。其中,ecircRNA主要存在于細胞質中,其可通過外顯子跳讀形成套索結構驅動成環或內含子堿基互補配對驅動成環。ciRNA主要存在于細胞核中,其形成依賴靠近5′剪切位點附近長7 nt的富含GU的片段和分支點附近的長11 nt的富含C的片段[7]。LI等[8]研究指出,ElciRNA可能由于在內含子堿基互補配對驅動形成ecircRNA時保留了內含子序列。
2.1miRNA海綿作用SALMENA等[9]于2011年提……