葉亮 李慧娟 張方 呂鏜烽 劉紅兵 宋勇
非小細胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)嚴重威脅我國人民健康,是致死率最高的惡性腫瘤之一,給社會造成了巨大的經濟負擔[1,2]。雖然近年發現了許多新的治療方式,但發現時大多處于中晚期,預后仍未得到顯著改善[3]。從分子水平研究NSCLC發生發展的機制有利于發現新的分子靶點,開發新的治療手段,對于減少患者痛苦和延長患者生存時間極為重要[4]。
Oncomine數據庫是目前全球最大的癌基因芯片數據庫和整合數據挖掘平臺,旨在挖掘癌癥基因信息。通過大學或研究機構郵箱可以免費注冊使用。迄今為止,該數據庫已經收集了715個基因表達數據集,86,733個癌癥組織和正常組織的樣本數據。利用Oncomine數據庫可以比較常見癌癥類型和各自正常組織的差異表達分選,也可以探索各種癌癥亞型以及基于臨床和病理學的分析,進行差異表達分選、共表達分析,查找某中癌癥中差異表達的基因,確定目的基因,進而確定研究方向,不僅可以節省科研成本,而且其信息也更加全面。
驅動蛋白超家族(kinesin family member, KIF)是一類基于微管的分子馬達蛋白,介導多種功能,其異常表達,在腫瘤的發生發展過程中扮演重要角色[5,6]。KIF23基因隸屬于KIF家族,研究發現,其在有絲分裂的胞質分離過程中起著重要作用,其表達缺失可導致有絲分裂停滯[7]。盡管既往研究表明KIF23在多種腫瘤組織和細胞中表達增高[8,9],但是在非小細胞肺癌組織中鮮有系統研究。
本研究利用Oncomine數據庫和Kaplan-Meier Plotters數據……