高通量測(cè)序分析人工養(yǎng)殖成年林麝糞便古菌菌群多樣性

王立志　徐誼英　蔡永華

(1.四川農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)研究所，動(dòng)物抗病營(yíng)養(yǎng)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，雅安625014；

2.四川養(yǎng)麝研究所，都江堰611845)

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高通量測(cè)序分析人工養(yǎng)殖成年林麝糞便古菌菌群多樣性

王立志1徐誼英1蔡永華2

(1.四川農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)研究所，動(dòng)物抗病營(yíng)養(yǎng)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，雅安625014；

2.四川養(yǎng)麝研究所，都江堰611845)

摘要：本試驗(yàn)的目的是采用高通量測(cè)序技術(shù)研究人工養(yǎng)殖成年林麝糞便中古菌的結(jié)構(gòu)和組成，并對(duì)比不同性別之間的差異。選取12只3歲健康的林麝依據(jù)性別分為雄性組(M組)和雌性組(F組)，每組各6只。采集其新鮮糞便，提取DNA，用古菌通用引物PCR擴(kuò)增古菌16S rRNA的V4～V5區(qū)，用MiSeq 300PE測(cè)序平臺(tái)對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行高通量測(cè)序，用QIIME等軟件對(duì)測(cè)序序列進(jìn)行分析統(tǒng)計(jì)。結(jié)果表明：在從門(mén)到屬的各級(jí)分類水平上，F(xiàn)組與M組古菌的相對(duì)豐度差異均不顯著(P>0.05)。M組和F組的組內(nèi)遺傳距離分別為0.16±0.03和0.27±0.06，組間為0.24±0.07，樣品的相似度很高。林麝糞便中的古菌可以分為3個(gè)門(mén)，優(yōu)勢(shì)門(mén)為闊古細(xì)菌門(mén)(Euryarchaeota)；在屬水平上可以分為7個(gè)已知屬，優(yōu)勢(shì)屬為甲烷短桿菌屬(Methanobrevibacter)，其次為熱裸單胞菌屬(Thermogymnomonas)。結(jié)果提示，雄性和雌性林麝糞便中古菌的結(jié)構(gòu)和組成都沒(méi)有顯著差異，Methanobrevibacter是林麝糞便中的優(yōu)勢(shì)古菌屬

關(guān)鍵詞：林麝；古菌；產(chǎn)甲烷古菌；多樣性

林麝(Moschusberezovskii)屬偶蹄目，麝科，麝屬，是一種珍貴的野生藥用、香料資源動(dòng)物，曾經(jīng)廣泛分布于我國(guó)的中部和南部[1]。近年來(lái)由于棲息地遭受破壞和過(guò)度捕獵，數(shù)量已急劇下降。目前已被國(guó)際自然和自然資源保護(hù)聯(lián)盟(IUCN)列為瀕危物種(http://www.iucnredlist.org/details/13894/0)。