李 雯,羅 虹,柴志欣,鐘金城*
(1.云南省種畜繁育推廣中心冷凍精液站,昆明 云南 650212;2.動物遺傳育種學國家民委-教育部重點實驗室,西南民族大學,四川 成都 610041)
牦牛FSHR基因5′端部分序列克隆及生物信息學分析
李 雯1,羅 虹2,柴志欣2,鐘金城2*
(1.云南省種畜繁育推廣中心冷凍精液站,昆明 云南 650212;2.動物遺傳育種學國家民委-教育部重點實驗室,西南民族大學,四川 成都 610041)
利用PCR和T-A克隆技術,測定了麥洼牦牛和雜種犏牛的FSHR基因5′端側翼區和第1外顯子的核苷酸序列,并運用BLAST、DNAMAN、Clustal等生物信息學軟件與其他物種的相應序列進行了同源性比對分析,為牦牛FSHR基因結構、犏牛雄性不育、牦牛遺傳多樣性,以及FSHR基因與牦牛的繁殖、產肉、產奶性狀相關分析提供了理論基礎。結果表明:牦牛和犏牛FSHR基因5′端側翼區長度為970 bp,普通牛、羊和豬的該序列長度分別為970、973和981 bp,序列長度差異較小;序列突變以堿基替換為主,牦牛與犏牛、普通牛、羊及豬的核苷酸序列一致性分別為99.4%、99.3%、98.2%、96.9%,一致性較高,為同源基因。聚類分析中牦牛與犏牛首先相聚,再依次與普通牛、羊、豬聚在一起。根據核苷酸序列推測,氨基酸組成分析顯示,牦牛和犏牛的該蛋白疏水性,蛋白的親水性和穩定性較差,為不穩定的脂溶性蛋白;二級結構主要以α螺旋和隨機卷曲為主。
牦牛;FSHR;基因克隆;序列分析
FSH是下丘腦分泌的一種多肽類物質,是FSH/LH/細胞因子受體超家族成員之一,能促進活化芳香化酶及誘導LH(促黃體素)受體的形成[1,2]。FSH能與FSHR結合,并由FSHR介導將信號傳入細胞內而產生一系列催化效應及機體免疫應答,從而對細胞代謝或功能活動產生影響?!?br>