ASIP蛋白與AgRP相關(guān)蛋白生物信息比較分析

馬建青，李祥龍,2*，周榮艷，李蘭會(huì)，楊清芳

(1.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 動(dòng)物科技學(xué)院，河北 保定 071001；2.河北科技師范學(xué)院 動(dòng)物科技學(xué)院，河北 昌黎 066600；3.河北省邢臺(tái)市農(nóng)業(yè)局動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心，河北 邢臺(tái) 054001)

科學(xué)研究

ASIP蛋白與AgRP相關(guān)蛋白生物信息比較分析

馬建青1，李祥龍1,2*，周榮艷1，李蘭會(huì)1，楊清芳3

(1.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 動(dòng)物科技學(xué)院，河北 保定 071001；2.河北科技師范學(xué)院 動(dòng)物科技學(xué)院，河北 昌黎 066600；3.河北省邢臺(tái)市農(nóng)業(yè)局動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心，河北 邢臺(tái) 054001)

利用生物信息學(xué)的方法研究人、綿羊和牛等18個(gè)物種Agouti 信號(hào)蛋白(ASIP)和Agouti 相關(guān)蛋白(AgRP)的編碼區(qū)及其對(duì)應(yīng)氨基酸序列的相關(guān)特征，以期探明兩種蛋白的遺傳分化特點(diǎn)。結(jié)果表明，在ASIP與AgRP均為399bp的CDS序列中，其核苷酸保守區(qū)域的位置分別在262～399 bp和230～399 bp處；ASIP和AgRP在各自CDS序列多態(tài)位點(diǎn)變異的各項(xiàng)指標(biāo)數(shù)值及其百分率大小上均極為接近；在46條ASIP的CDS序列及32條AgRP的CDS序列中，二者的單倍型數(shù)分別為22種和23種，ASIP和AgRP在基因的進(jìn)化以及不同物種的遺傳分化上具有相似性；兩者的氨基酸序列在98～140 aa片段處保守性較高，該區(qū)域同時(shí)富含半胱氨酸(Cys)；ASIP和AgRP一級(jí)結(jié)構(gòu)的理化性質(zhì)表現(xiàn)為共性與差異并存；二者的肽鏈C端具有相似的三維結(jié)構(gòu)，但各自也具有其結(jié)構(gòu)特異性。

Agouti；ASIP；AgRP；生物信息學(xué)

Agouti基因，通常翻譯成“南美豚鼠外表顏色基因”[1]或者“刺豚鼠毛色基因”、“鼠灰色基因”[2]。Agouti信號(hào)蛋白(Agouti signaling protein,ASIP)是Agouti基因編碼的產(chǎn)物。繼ASIP發(fā)現(xiàn)之后，研究人員在尋找Agouti同源基因時(shí)又發(fā)現(xiàn)了此同源基因編碼的一種與蛋白ASIP的大小與結(jié)構(gòu)相似的同源蛋白，即Agouti相關(guān)蛋白(Agouti-related protein,AgRP)[3-4]。……