基于分子對接分析復方一枝黃花噴霧劑抗HIV-1蛋白酶和組織蛋白酶 L的研究

朱海燕 莊田畋 楊 欣 危 英* 李 星 陳 梅 夏 文 周 英

1.貴州中醫藥大學，貴州 貴陽 550025；2.貴州百靈制藥股份有限責任公司，貴陽 安順 550001

復方一枝黃花噴霧劑由一枝黃花、貫眾、山銀花、連翹、荊芥、艾納香、薄荷制成的噴霧劑[1]。由貴州百靈企業集團制藥股份有限公司生產，主要功效為清熱解毒，宣散風熱，清利咽喉。用于上呼吸道感染，急、慢性咽炎，口舌生瘡，牙齦腫痛，口臭[2]。已有文獻[3-5]報道一枝黃花、山銀花、貫眾、連翹等中藥具有抗病毒的作用。但是復方一枝黃花噴霧劑對HIV-1蛋白酶和Cathepsin L蛋白酶活性的影響尚未研究。目前，在藥物研發的過程中，很多中藥及復方的活性化合物的篩選依靠分子對接完成，優化的小分子與蛋白通過計算機模擬打分，快速有效地發現小分子活性成分[6]。分子對接技術已經應用到很多領域，得到的結果較為理想[7]。因此本研究采用藥物分子設計模擬 SYBYL 2.1.1 軟件的Surflex-Dock和模塊完成復方一枝黃花噴霧劑藥效物質與HIV-1蛋白酶和Cathepsin L蛋白酶的分子對接分析，為發現及開發抗病毒藥物提供理論依據。

1 數據庫及軟件

中藥系統藥理學數據庫和分析平臺TCMSP(http://ibts.hkbu.edu.hk/LSP/.tcmspsearch)；SwissADME(http://www.swissadme.ch/)；蛋白質晶體結構數據庫RCSB (http://www. rcsb. org/pdb )；SYBYL 2.1.1(Tripos)處理器為Inter(R) Core(TM) i5-7500 CPU@3.4GHz，64位操作系統，軟件已授權。

2 實驗方法

2.1 復方一枝黃花噴霧劑活性成分篩選 通過中藥系統藥理學數據庫和分析平臺(TCMSP)相關指標[8]：口服生物利用度(Oral Bioavailability,OB)、分子量(Molecular Weight ,MW)、類藥性(Drug Likeness,DL)篩選丹參化學成分，OB通過OBioavail模型對進行預測，DL通過Tanimoto 系數通過藥物之間的Tanimoto進行計算。一般認為OB大的化學成分具有好的口服生物利用度，DL≥0.18 的分子具有較好的類藥性。……