馮帥華,徐無忌,仇湘中,吳官保,張信成,謝 芳,廖建暉
(1.湖南省中醫藥研究院附屬醫院,湖南 長沙 410006;2.湖南中醫藥大學第二附屬醫院,湖南 長沙 410005)
腰椎間盤退變(Lumbar disc degeneration,LDD)是臨床導致下腰痛常見的原因之一,其以髓核細胞增殖活性及數量減少、細胞外基質的合成與分解失衡為病理特點[1]。根據《全球疾病負擔》報告,下腰痛是導致殘疾的主要原因之一,占總致殘率的10.7%[2]。六味地黃丸是滋陰補腎的經典名方,對腎陰虛型LDD有突出療效[3]。目前,六味地黃丸干預LDD的具體作用機制尚不明確,本研究利用網絡藥理學方法,挖掘六味地黃丸治療LDD的作用機制。
1.1 資料來源 中藥系統藥理學數據庫與分析平臺(Traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)、Gene Cards數據庫、OMIM數據庫、Uniprot數據庫。
1.2 研究方法
1.2.1 六味地黃丸有效成分及作用靶點篩選:應用TCMSP數據庫檢索六味地黃丸中熟地黃、山茱萸、牡丹皮、山藥、澤瀉、茯苓的有效成分。以口服生物利用度(Oral bioavailability,OB)>30%、類藥性(Drug likeness,DL)>0.18為檢索條件對檢索結果進行篩選,得到六味地黃丸的有效成分。通過TCMSP數據庫檢索六味地黃丸有效成分的全部靶點,通過Perl插件篩選出六味地黃丸有效成分的作用靶點。
1.2.2 LDD疾病靶點篩選:本研究設置檢索詞為“Lumbar disc degeneration”,檢索Gene Cards數據庫及OMIM數據庫,以相關性分數≥7為限制條件對檢索結果進行篩選,并應用Uniprot數據庫對疾病靶點進行標準化。
1.2.3 共同靶點篩選及PPI網絡構建:應用相關軟件篩選出六味地黃丸中藥物有效成分與LDD的共同作用靶點。在String數據庫中輸入共同作用靶點,物種設置為人類蛋白,以0.7為最低互動分數,通過數據庫建立蛋白互作網絡(Protein protein interaction,PPI)。通過……