肝細(xì)胞癌進(jìn)展過程中的關(guān)鍵基因ATP1B3和ENAH的篩選與鑒定：基于數(shù)據(jù)挖掘和臨床驗(yàn)證

肝細(xì)胞癌（HCC）是一個(gè)主要的全球健康問題和死 亡原因。據(jù)世界衛(wèi)生組織估計(jì)，到2030年，將有超過100 萬人死于HCC，與其他癌癥相比，HCC 發(fā)病率在2020年繼續(xù)以更快的速度上升。這種癌癥的主要病因包括代謝紊亂、肝炎病毒的慢性感染、吸煙和過量飲酒等。不管肝臟的病因如何，HCC與肝纖維化和肝硬化密切相關(guān)。HCC預(yù)后的一個(gè)重要部分取決于潛在的慢性肝病，這也是其發(fā)生的危險(xiǎn)因素。肝硬化死亡率的Child-Pugh評分對于患者分層至關(guān)重要。大約80%～90%的HCC有潛在肝纖維化，大約三分之一的肝硬化患者會(huì)發(fā)展成HCC。由于早期臨床癥狀不明顯，發(fā)病機(jī)制不明，HCC確診時(shí)通常為晚期或已發(fā)生遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移，增加治療難度，且預(yù)后較差。目前，常用的HCC診斷方法，如血清腫瘤標(biāo)志物、影像學(xué)技術(shù)等臨床效果并不理想。篩選與HCC早期診斷和不良預(yù)后相關(guān)的標(biāo)志物，對于提高HCC的治療效果和預(yù)后至關(guān)重要。隨著多組學(xué)分析方法的應(yīng)用，大量重要分子被發(fā)現(xiàn)并成功應(yīng)用于臨床診斷和治療。但是，從肝纖維化進(jìn)展到HCC是一個(gè)漫長的過程，其機(jī)制非常復(fù)雜，目前尚未發(fā)現(xiàn)能作為HCC進(jìn)程的標(biāo)記物。因此，我們通過生物信息學(xué)數(shù)據(jù)挖掘，著眼于HCC進(jìn)程中各疾病表型之間的基因變化，找到與HCC進(jìn)展相關(guān)的新基因，以期作為HCC的診斷和預(yù)后的新靶點(diǎn)。

1 材料和方法

1.1 數(shù)據(jù)集選擇

從TCGA數(shù)據(jù)庫（https://portal.gdc.cancer.gov/）下載374 個(gè)HCC 和50 個(gè)正常組織的表達(dá)譜，從GEO（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/database）獲取HBV相關(guān)肝纖維化患者基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)集GSE84044、正常與肝硬化相關(guān)數(shù)據(jù)集GSE14323、肝硬化與HCC相關(guān)數(shù)據(jù)集GSE63898。其中……