新型冠狀病毒棘突蛋白免疫原性分析及其多肽疫苗設(shè)計(jì)研究

許志強(qiáng)，魯 陳，胡曉軍，郭 有，胡巧麗，朱 穎,4

(1.南京醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院，江蘇 南京 210000；2.贛南醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院；3.贛州市疾病預(yù)防控制中心，江西 贛州 341000；4.南昌大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院，江西 南昌 330031)

至2020年3月4日，我國被確診感染新型冠狀病毒肺炎患者超過8萬人，并導(dǎo)致超過3千名患者死亡，且確診和死亡人數(shù)仍在每日增加(http://www.nhc.gov.cn/)，對(duì)國民生活、經(jīng)濟(jì)秩序造成極其嚴(yán)重的影響。目前，國際病毒分類委員會(huì)已將這種新型冠狀病毒命名為“SARS-CoV-2”，而由此病毒感染的肺炎也被命名為“COVID-19”(Corona Virus Disease 2019)。

冠狀病毒是一種具有包膜的單股正鏈RNA病毒。SARS-CoV-2屬于β-冠狀病毒，具有典型的冠狀病毒基因組結(jié)構(gòu)。棘突蛋白(spike protein, S)位于SARS-CoV-2病毒包膜表面，可與宿主細(xì)胞膜特定受體結(jié)合，在病毒侵入和感染細(xì)胞中具有至關(guān)重要的作用。盡管SARS-CoV-2的S蛋白在多種冠狀病毒中表現(xiàn)出高度的變異，但是它與引起嚴(yán)重急性呼吸道綜合征(severe acute respiratory syndrome，SARS)的SARS-CoV病毒表面的S蛋白具有較高的同源性。SARS-CoV-2與SARS-CoV的S蛋白在其受體結(jié)合域(receptor-binding domain, RBD)具有幾乎相同的三維空間結(jié)構(gòu)，表明SARS-CoV-2與SARS-CoV作用的受體相同，即都是通過S蛋白-血管緊張素轉(zhuǎn)化酶2(angiotensin-converting enzyme 2, ACE2)結(jié)合途徑感染支氣管上皮細(xì)胞和肺上皮細(xì)胞[1]。截至2020年3月5日，SARS-CoV-2感染病例仍在增加，因此，有效的疫苗研發(fā)至關(guān)重要。

目前，已有大量的藥物可作為SARS-CoV-2感染后的輔助治療，包括廣譜的病毒靶向藥物，宿主靶向藥物和中藥等[2-3]。然而，市場(chǎng)上還沒有特異性針對(duì)SARS-CoV-2的藥物或疫苗，一些新型藥物的研制也處于早期階段。基于S蛋白在SARS-CoV-2病毒感染中的關(guān)鍵作用，其有望成為治療藥物設(shè)計(jì)靶點(diǎn)。……