吳青峻 田文鑫 于瀚博 黃川 焦鵬 馬超 王永忠 黃文 孫耀光 艾斌 佟宏峰
作為遺傳信息的載體,基因組DNA很容易受到化學(xué)(如烷化劑)、物理(如紫外線)和生物作用(如活性氧)的損傷,這也是癌癥成為現(xiàn)代社會人類生命首要威脅的原因之一。據(jù)報(bào)道,僅活性氧就可造成真核生物每個(gè)細(xì)胞、每天產(chǎn)生至少10,000個(gè)DNA損傷位點(diǎn)[1]。堿基切除修復(fù)(base excision repair, BER)是細(xì)胞應(yīng)對DNA損傷并自行修復(fù)的重要途徑之一,DNA聚合酶β是參與BER過程最主要的DNA聚合酶,具有DNA聚合和dRP裂解酶雙重活性[2]。國外已有研究[3]表明,約30%的常見腫瘤中存在DNA聚合酶β突變體,但受到所用標(biāo)本量的限制(7種腫瘤僅149例病例),其結(jié)論是否準(zhǔn)確尚待進(jìn)一步證實(shí)。例如早期在結(jié)直腸癌中的研究僅有6例標(biāo)本入組,有5例攜帶突變,突變率高達(dá)83%[4],但隨后較大樣本的篩查表明,僅40%的腫瘤組織發(fā)現(xiàn)存在DNA聚合酶β突變體[5]。Bhattacharyya等[6]最早檢測了肺癌腫瘤組織中DNA聚合酶β的突變情況,通過對11例肺癌患者癌組織和癌旁組織的RT-PCR檢測,共發(fā)現(xiàn)了3種不同的變異體類型,但這些變異類型并不是腫瘤特異性表達(dá)的突變類型。目前還尚未見中國人群肺癌組織中DNA聚合酶β的突變情況的文獻(xiàn)報(bào)道。本研究通過對69例肺癌患者腫瘤及癌旁組織開展DNA聚合酶β編碼基因Polb的全外顯子測序分析,系統(tǒng)研究了我國漢族肺癌患者中DNA聚合酶β的遺傳突變規(guī)律。
1.1 樣本基本信息 收集2018年2月-2018年9月北京醫(yī)院住院收治的69例漢族肺癌患者的新鮮組織,術(shù)中取腫瘤組織及距腫瘤組織2 cm-3 cm處的癌旁組織,樣本離體后5 min內(nèi)分裝至2 mL凍存管并迅速放至液氮中速凍,并置-80 ℃長期儲存?zhèn)溆谩!?br>