基于16S rRNA測序分析奶牛體外發酵中瘤胃細菌多樣性的變化

李燁青 奚雨萌 曾涵芳 張 林 陳孟姣 韓兆玉

(南京農業大學動物科技學院，南京210095)

瘤胃是一個復雜的生態系統，內含多種多樣的古細菌、真菌及原蟲等，它們在維持瘤胃內環境穩定和影響奶牛健康方面起關鍵作用。這些瘤胃微生物具有高度特異性，它們消化代謝產生的能量可以被奶牛利用，對營養物質的消化起著關鍵的作用，還可能會提高宿主對入侵的病原體的抵抗力[1]。細菌是瘤胃中數量最多的一種微生物，其中分解粗飼料中的纖維物質主要是靠纖維素分解菌，如絲桿菌(Fibrobacter)、瘤胃球菌(Ruminococcus)、丁酸弧菌(Butyrivibrio)等。產琥珀酸絲狀桿菌(Fibrobactersuccinogenes)具有很強的分解纖維素能力，其發酵產物有乙酸和琥珀酸，這種菌對抗生素也有很強的耐受力。另外，擬桿菌門(Bacteroidetes)中的普雷沃氏菌屬(Prevotella)是瘤胃優勢菌屬，它們可以分解蛋白質、淀粉、多糖，但不能分解纖維素。總之，多種微生物相互作用、相互制約，共同維持瘤胃內環境穩定，對于促進奶牛消化代謝、維持奶牛健康、提高生產性能具有重要意義。因此，對瘤胃微生物區系變化的研究是十分必要的。

產氣法是應用較廣、操作較簡單、重復性較高的體外發酵方法之一，常用來評價飼料消化率、評估飼料添加劑效果等。大多數體外發酵試驗研究底物精粗比和添加劑等對瘤胃微生物區系的影響[2-6]，但是在正常飼糧作為發酵底物時，用體外發酵法研究瘤胃微生物區系隨時間變化的報道較少。因此，了解產氣法系統帶來的瘤胃微生物區系變化，完善現有條件下的科研工作具有現實意義。……