腎癌組織中卷曲螺旋結(jié)構(gòu)域蛋白62的HLA-A2表位肽的篩選和鑒定

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(1.鄭州大學(xué)第一附屬醫(yī)院，河南 鄭州 450052；2.鄭州大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院，河南 鄭州 450001)

腎癌在全球惡性腫瘤之中占3%,發(fā)病率和病死率均較高[1]。而且,腎癌對(duì)于化療和放療的治療效果都不太理想，并且尚未發(fā)現(xiàn)十分有效的輔助治療方法。細(xì)胞毒性T細(xì)胞(cytotoxic lymphocyte,CTL)是淋巴細(xì)胞的一種，這種淋巴細(xì)胞就是專門的CD8+T細(xì)胞,這種特定類型的免疫淋巴細(xì)胞可以消滅另一種特定的細(xì)胞。CTL在與腫瘤研究相關(guān)的領(lǐng)域里面發(fā)揮著獨(dú)特的意義。能消滅另一種特定細(xì)胞的關(guān)鍵就在一種特殊的復(fù)合物。這種復(fù)合物的特點(diǎn)就是抗原肽和目的腫瘤細(xì)胞表面的主要組織相容性復(fù)合物(major histocompatibility complex，MHC)-Ⅰ合在一起，從而才能被CD8+T細(xì)胞發(fā)現(xiàn)進(jìn)而發(fā)生消滅腫瘤細(xì)胞的行為。卷曲螺旋結(jié)構(gòu)域蛋白62(coiled-coil domain containing patients 62， CCDC62)是一種腫瘤-睪丸抗原。正常的機(jī)體組織中，僅能在睪丸組織中檢測(cè)到CCDC62的mRNA表達(dá)，但在結(jié)直腸癌、胃癌、頭頸癌、腎癌等腫瘤組織中也有一定的表達(dá)[2]。目前，用于治療各種腫瘤的肽疫苗正處于臨床研究的活躍階段。抗原肽需要針對(duì)特定的人類白細(xì)胞抗原(human leukocyte antigen, HLA)分型進(jìn)行預(yù)測(cè)。在我國(guó)人群中，HLA-A2的分型占到了45%左右。因此，針對(duì)HLA-A2的表型預(yù)測(cè)有著很重要的意義[3]。本研究通過(guò)NetCTL1.2軟件進(jìn)行生物信息學(xué)綜合預(yù)測(cè)，篩選出得分較高的抗原表位，并進(jìn)一步進(jìn)行CCDC62表位肽表位的篩選和鑒定。

1 材料與方法

1.1材料T2A2細(xì)胞由鄭州大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院實(shí)驗(yàn)室常規(guī)保存，采用體積分?jǐn)?shù)5% CO2、37 ℃條件下常規(guī)培養(yǎng)。外周血單個(gè)核細(xì)胞采集自鄭州大學(xué)第一附屬醫(yī)院的腎癌患者，所有病例均經(jīng)病理學(xué)檢查確診。……