2009至2016年中國甲型H1N1流感病毒神經(jīng)氨酸酶基因進化分析及流行趨勢預(yù)測

宋玥，顏文娟，方坤，李小杉，李偉，衛(wèi)平民

(1.東南大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院，南京 210009；2.南京市疾病預(yù)防控制中心急性傳染病防制與學(xué)校衛(wèi)生科，南京 210009)

·調(diào)查研究·

2009至2016年中國甲型H1N1流感病毒神經(jīng)氨酸酶基因進化分析及流行趨勢預(yù)測

宋玥1，顏文娟1，方坤1，李小杉1，李偉2，衛(wèi)平民1

(1.東南大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院，南京 210009；2.南京市疾病預(yù)防控制中心急性傳染病防制與學(xué)校衛(wèi)生科，南京 210009)

目的 分析2009至2016年中國甲型H1N1流感病毒神經(jīng)氨酸酶基因(NA)進化特征，預(yù)測其流行趨勢，為流感疫苗評價提供依據(jù)。方法 從全球共享禽流感數(shù)據(jù)倡議組織(GISAID)數(shù)據(jù)庫及美國國家生物技術(shù)中心(NCBI)數(shù)據(jù)庫下載甲型H1N1流感病毒NA基因序列1 141條。利用鄰接法進行系統(tǒng)進化分析和遺傳變異分析，利用Bayesian skyline Plot預(yù)測流行趨勢。結(jié)果 2009至2016年中國甲型H1N1毒株NA基因與參考毒株的同源性逐年降低。遺傳進化分析顯示同一年份的毒株在系統(tǒng)進化樹上基本呈現(xiàn)集中分布。除2012年，其余各年份的毒株均通過不同模型得到正向壓力選擇位點。動力學(xué)分析顯示2017年甲型H1N1可能達到一個流行高峰。結(jié)論 甲型H1N1流感病毒NA基因所編碼的氨基酸逐年變異，需進一步加強流感監(jiān)測。

甲型H1N1流感；神經(jīng)氨酸酶；分子特征；進化分析

甲型H1N1流感病毒[influenza A viruses(H1N1 09pdm)]是由禽流感、豬流感和人流感病毒3者基因重配而成[1-2]，自感染暴發(fā)以來，H1N1(09pdm)在人群中一直引起較高的發(fā)病率，也因此受到國內(nèi)外研究的廣泛關(guān)注。

流感病毒基因組由8個片段構(gòu)成，其中神經(jīng)氨酸酶(neuraminidase,NA)是流感病毒在傳播和擴散中最關(guān)鍵的酶。……