王昭云 那冬晨


摘要 [目的]優化馬齒莧ISSR-PCR反應體系與反應條件。[方法]以馬齒莧為試驗材料,采用改良的CTAB法提取總DNA,對ISSR-PCR引物進行篩選,同時進行ISSR-PCR反應體系和反應條件的優化,電泳檢測ISSR-PCR產物。[結果]8個ISSR引物適合馬齒莧的ISSR-PCR分析;最適反應體系為總體系25.0 μL,其中2×Taq Platinum PCR Master Mix 12.5 μL,10 μmol/L引物2.0 μL,40 mg/L DNA模板1.0 μL,ddH2O 9.5 μL;最適反應條件為94 ℃預變性360 s;
94 ℃變性60 s,54 ℃退火60 s,72 ℃延伸90 s,30次循環;72 ℃再延伸300 s。[結論]建立了馬齒莧ISSR-PCR擴增的最佳反應體系和擴增程序,為進一步研究馬齒莧提供基礎資料。
關鍵詞 馬齒莧;ISSR-PCR;反應體系;反應條件
中圖分類號 S647 文獻標識碼 A 文章編號 0517-6611(2017)13-0147-02
Optimization of ISSR-PCR Reaction System and Reaction Condition of Portulaca oleracea L.
WANG Zhao-yun1,NA Dong-chen1,2 *
(1.Modern College of Arts and Sciences,Shanxi Normal University, Linfen,Shanxi 041000;2.College of Life Sciences,Shanxi Normal University,Linfen,Shanxi 041000)
Abstract [Objective]To optimize ISSR-PCR reaction system and reaction condition of Portulaca oleracea L.[Method]Taking P.oleracea L.as the research object,using improved CTAB method to extract total DNA of P.oleracea L.,the ISSR-PCR primers were screened,at the same time ISSR-PCR reaction system and reaction condition were optimized to test ISSR-PCR products by electrophoresis.[Result]Eight primers were suitable for ISSR-PCRof P.oleracea L..The optimal reaction system was that total reaction system 25.0 μL,including 12.5 μL 2×Taq Platinum PCR Master Mix,2.0 μL 10 μmol/L primers,1.0 μL 40 mg/L DNA templates,9.5 μL ddH2O.The optimal reaction condition was that pre-degeneration at 94 ℃ for 360 s,going to 30 cycles:degeneration at 94 ℃ for 60 s,annealing at 54 ℃ for 60 s,extension at 72 ℃ for 90 s,then extension at 72 ℃ for 300 s after 30 cycles.[Conclusion]The optimizing ISSR-PCR reaction system and reaction condition of P.oleracea L.were established to provide basis for further study P.oleracea L..
Key words Portulaca oleracea L.;ISSR-PCR;Reaction system;Reaction condition
馬齒莧(Portulaca oleracea L.)為馬齒莧科馬齒莧屬一年生草本植物,藥食兩用[1]。全株無毛,莖紫紅色,圓柱形,平臥或斜倚,伏地鋪散,葉互生,有時近對生,葉片扁平,肥厚,倒卵形,頂端圓鈍或平截,有時微凹,基部楔形,全緣[2]。馬齒莧適應性強,適宜在溫暖、濕潤、肥沃的壤土或沙壤土中生長,耐旱亦耐澇,生于田野路邊及庭園廢墟等向陽處,國內各地均有分布。
ISSR是在簡單重復序列(SSR)基礎上發展起來的新型分子標記,由加拿大蒙特利爾大學的Zietkiewicz等[3]提出。ISSR綜合了其他分子標記高多態性、可重復性、低成本、易操作以及無需知道基因組序列等優點[4-5],現已被廣泛應用于鑒定種質、分析遺傳關系、構建遺傳圖譜等研究[6]。該研究以馬齒莧為試驗材料,對影響ISSR-PCR反應體系的各因素進行優化,建立馬齒莧ISSR-PCR擴增的最佳反應體系和擴增程序,為進一步研究馬齒莧提供基礎資料。
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 植物材料。
馬齒莧,采于山西省臨汾市汾河公園,該地處于半干旱、半濕潤的氣候區,屬暖溫帶大陸型氣候,冬寒夏熱,四季分明,雨熱同期。……