琚明亮黃濤劉成林潘曉歐賀林陳文忠蔡雷
·論 著·
精神分裂癥和抗結核藥物所致肝損傷共同致病基因的篩選與驗證
琚明亮*黃濤△劉成林※潘曉歐*賀林*陳文忠*蔡雷*
目的 篩選并驗證抗結核藥物所致肝損傷(anti-tuberculosis drug-induced hepatotoxicity,ATDH)與精神分裂癥(schizophrenia,SCZ)之間可能的共同致病基因。 方法 通過查詢基因數據庫及文獻,分別確定ATDH 和SCZ的致病基因,利用重啟動隨機游走(integrating network random walk with restart,RWR)、基因富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)和超幾何檢驗等生物信息學分析技術篩選出兩種疾病的可能共同致病基因,建立定期更新的兩種疾病共同致病基因在線數據庫(www.bio-x.cn/atdh-sczgenes.html),查閱文獻以進一步篩選與ATDH和SCZ都有關的基因;利用meta分析等方法驗證候選基因,以最終確定共同致病基因。 結果經信息學分析技術篩選,共獲得500個候選共同致病基因。進一步經文獻檢索,得到GSTM1和GSTT1基因為候選共同致病基因并納入meta分析。Meta分析顯示,GSTM1基因同ATDH(P=0.01)和SCZ(P<0.01)相關均有統計學意義;而GSTT1基因同ATDH和SCZ的發病風險關系均無統計學意義(P>0.05)。結論 GSTM1基因為ATDH 和SCZ的共同致病基因。
精神分裂癥 抗結核藥物所致肝損傷 基因 Meta分析
精神分裂癥(schizophrenia,SCZ)目前病因不明,但家系調查、雙生子流行病學研究已經證實,SCZ是一種多基因遺傳病[1]。肺結核是由結核分枝桿菌引起的通過呼吸道傳播的傳染性疾病。前期研究顯示,SCZ和肺結核病之間存在分子上的關聯[2-3];且SCZ會增加肺結核的發病風險[4-5],精神分裂癥患者中肺結核的發病率為2.63%,明顯高于同地區普通人群。在接受抗結核治療時,33%的患者會出現抗結核藥物所致肝損傷(anti-tuberculosis drug-induced hepatotoxicity,ATDH)[5]。……