人巨細胞病毒US31基因序列特征分析及B細胞表位預測

郭剛強，謝尙丹，葉思思，孫祥威，張良，張麗芳，薛向陽

（1.溫州醫科大學 微生物學與免疫學教研室 分子病毒與免疫研究所 熱帶醫學研究所，浙江 溫州325035；2.溫州醫科大學 第二臨床醫學院，浙江 溫州 325035；3.溫州醫科大學附屬第一醫院 胃腸外科，浙江 溫州 325015）

·論 著·

人巨細胞病毒US31基因序列特征分析及B細胞表位預測

郭剛強1，謝尙丹2，葉思思1，孫祥威3，張良3，張麗芳1，薛向陽1

（1.溫州醫科大學 微生物學與免疫學教研室 分子病毒與免疫研究所 熱帶醫學研究所，浙江 溫州325035；2.溫州醫科大學 第二臨床醫學院，浙江 溫州 325035；3.溫州醫科大學附屬第一醫院 胃腸外科，浙江 溫州 325015）

目的：分析人巨細胞病毒（HCMV）US31基因序列，預測US31基因編碼蛋白的B細胞優勢表位。方法：基于US31基因編碼蛋白的氨基酸序列，結合親水性參數、可及性參數、抗原性參數、柔韌性參數及二級結構方案對HCMV US31基因編碼各型蛋白的B細胞表位進行預測，參照已建立的預測方法綜合評價US31基因B細胞優勢表位。結果：US31核苷酸序列變異較少，大部分是同義突變，氨基酸序列高度保守；其編碼蛋白全長為162個氨基酸，相對分子質量20 kD，等電點7.66，為可溶性蛋白，二級結構中以無規則卷曲為主。經綜合分析，US31基因的B細胞優勢表位可能存在于氨基酸序列N端的5～19、32～47、58～68、110～124區段。結論：多參數預測HCMV pUS31的B細胞優勢表位，為進一步研究蛋白特征、制備單克隆抗體及表位疫苗提供依據。

人巨細胞病毒；US31基因；B細胞表位

人巨細胞病毒（human cytomegalovirus，HCMV）屬皰疹病毒科β亞科，為雙鏈DNA病毒，基因組全長約230～240 kb，含208個開放讀碼框，由長獨特序列（unique long domains，UL）和短獨特序列（unique short domains，US）2個片段組成。……