曹美群,孫珂煥,吳安民,陳德珩,吳正治
(1.暨南大學(xué) 第二臨床醫(yī)學(xué)院 深圳市老年醫(yī)學(xué)研究所, 廣東 深圳 518020;2.深圳大學(xué) 第一附屬醫(yī)院, 廣東 深圳 518039)
研究論文
應(yīng)用iTRAQ定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法篩選乳腺癌患者血清差異表達(dá)蛋白
曹美群1,孫珂煥1,吳安民1,陳德珩1,吳正治2*
(1.暨南大學(xué) 第二臨床醫(yī)學(xué)院 深圳市老年醫(yī)學(xué)研究所, 廣東 深圳 518020;2.深圳大學(xué) 第一附屬醫(yī)院, 廣東 深圳 518039)
目的篩選乳腺癌患者血清特異性表達(dá)蛋白,以尋找乳腺癌早期診斷的生物標(biāo)志物。方法采集血清,提取蛋白,iTRAQ標(biāo)記和ESI-QTOF-QⅡ質(zhì)譜檢測,再搜庫和Scaffold軟件分析,得到各組間血清差異表達(dá)蛋白。進(jìn)一步采用Western blot驗(yàn)證差異蛋白。結(jié)果血清中共鑒定出335個蛋白,達(dá)到嚴(yán)格定量標(biāo)準(zhǔn)的蛋白151個;乳腺癌與對照組間共篩選出23個差異表達(dá)蛋白;乳腺癌與乳腺纖維瘤組間篩選出8個差異蛋白。Western blot驗(yàn)證Serotran-sferrin,Vitronectin,soform 1 of Gelsolin 3 個蛋白在各組中的表達(dá)結(jié)果與iTRAQ檢測結(jié)果一致。結(jié)論本研究證實(shí)iTRAQ-LC-MS/MS 技術(shù)能夠快速、有效地進(jìn)行差異蛋白質(zhì)組學(xué)研究,并篩選到多個與乳腺癌發(fā)病相關(guān)的血清蛋白,有可能作為乳腺癌早期診斷的生物標(biāo)志。
乳腺癌;iTRAQ;蛋白質(zhì)組學(xué);血清;生物標(biāo)志物
乳腺癌是女性最常見的惡性腫瘤。近年來,乳腺癌發(fā)病率在中國尤其是發(fā)達(dá)地區(qū)呈快速增長趨勢,已躍居女性惡性腫瘤發(fā)病率之首[1]。目前臨床上對乳腺癌早期診斷缺乏有效手段,血清蛋白質(zhì)組學(xué)的出現(xiàn)為尋找有效的臨床生物標(biāo)志物提供了全新的方法。近年來同位素標(biāo)記相對和絕對定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation, iTRAQ)技術(shù)為解決低豐度蛋白的定性、定量研究提供了有效方法[2]。……