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胡柚上柑橘衰退病毒的分子檢測

2011-04-10 02:16:24武曉云郭玉雙武小霞
東北農業大學學報 2011年7期
關鍵詞:癥狀檢測

武曉云,劉 琦,郭玉雙,武小霞

(1.浙江農林大學農業與食品科學學院,浙江 臨安 311300;2.黑龍江省農業科學院園藝分院,哈爾濱 150086;3.貴州省煙草科學研究所,貴陽 550081;4.東北農業大學農學院,大豆生物學教育部重點實驗室,哈爾濱 150030)

胡柚(Citrus changshanensis)原產于浙江省常山縣,是一種重要的地方特色柑橘良種[1]。胡柚果實色澤艷麗、果型美觀、耐儲藏,并且富含多種維生素和人體必需氨基酸和豐富的柑橘類黃酮物質,如柚皮苷(Naringenin)和新桔皮苷(Neohesperidin)等,因此是一種非常值得推廣和扶持的柑橘品種[2]。目前,胡柚已成為我國主要栽培柑橘品種之一:全國的種植面積多達一百多萬畝,栽培種植的省份包括浙江省、江西省、福建省和湖南省、年均產量100多萬t,年產值近20億元。

胡柚黃斑病是胡柚常見病害之一,染病植株葉片較正常植株明顯減少,并且葉片出現黃化癥狀,植株不能結果或減少,并且果實出現變小、酸味增加。該病害最早報道于上世紀90年代,由于當時條件所限該病害被認為由真菌或細菌引起[3-4]。近年來,該病害的發生范圍不斷擴大,有暴發流行之趨勢,該病害已嚴重影響胡柚的產量和品質,可能對胡柚整個產業的進一步發展造成嚴重影響。但是,該病害的病原至今未能得到系統的鑒定,因此嚴重影響相應防治措施的制定。本文通過血清學和分子生物學檢測,從癥狀表現葉片黃化的胡柚植株中檢出柑橘衰退病毒(Citrus tristeza virus,CTV),并對胡柚上克隆CTV病毒外殼蛋白(CP)基因的序列與GenBank中登陸的相應序列進行了分析,結果表明胡柚黃斑病可能由CTV一個新的分離物引起。

1 材料與方法

1.1 樣品采集

胡柚葉片采集自浙江省常山縣,癥狀表現為葉片黃化,具體采集信息見表1。

表1 胡柚樣品采集地點、采集時間及癥狀Table 1 List of sampling locations and time,and symptoms of Huyou

1.2 血清學檢測

采用Agdia公司的CTV ELISA Reagent Set試劑盒進行DAS-ELISA檢測,并參照Agdia公司提供的試劑盒說明書進行。DAS-ELISA的陽性對照購自Agdia公司,陰性對照采用健康胡柚葉片(由常山縣農業局植保植檢站提供)。

1.3RT-PCR擴增和克隆

用TRIzol Reagent(Invitrogen公司)提取胡柚葉片的總RNA。根據文獻[5]報道,設計CTV外殼蛋白(CP)基因的通用引物 CP1(5′ATGGACGACGAAA CAAAGA 3′)和 CP3(5′TCAACGTGTGTTGAATTTCC 3′)。用M-MLV試劑盒(Promega公司)根據試劑盒提供的試驗步驟配制反轉錄反應混合液,以CP3為引物合成cDNA第一鏈。以CP1和CP3為引物進行PCR擴增,擴增產物用1%瓊脂糖進行電泳檢測。擴增片段用DNA膠回收試劑盒(Axygen公司)進行回收后,連接至pGEM-T載體(Promega公司)中,并進行測序測定。

1.4 序列分析

序列拼接和同源性分析采用DNAman 6.02(Lynnon Biosoft)程序進行;應用Clustal X 1.83程序進行多序列比對[6],用MEGA4.0程序中的最大簡約法(Maximum parsimony,MP)構建系統進化樹,進化樹的可信度用bootstrap進行檢測(1 000次重復)[7]。系統進化樹中其他CTV分離物及GenBank登錄號如下:B165(Accession EU076703)、Mexico(DQ272579)、NUagA(AB046398)、NZ-B18(FJ525436)、NZRB-G90(FJ525432)、NZRB-M12(FJ525431)、NZRB-M17(FJ525435)、NZRB-TH28(FJ525433)、NZRB-TH30(FJ525434)、Qaha(AY340974)、SY568(AF001623)、T30(AF260651)、T36(U16304)、T318A(DQ151548)、T385(Y18420)、HA16-5(GQ454870)、P09.18(GQ424346)和 VT(U56902)。

2 結果與分析

2.1 田間癥狀觀察

對浙江省主要胡柚種植區衢州市和常山縣5處胡柚種植株園的胡柚的田間調查表明,胡柚黃化病的發病率在2.3%左右。癥狀主要包括植株葉片減少、脈間黃化(見圖1),結果數量及質量降低,大部分發病植株的莖部不出現莖點的癥狀,少數植株具輕微的莖點癥狀。由于發病植株分布具有分散性和不連續性,且路邊植株的發病率較中間高,具有病毒病害的特征。

圖1 胡柚黃化癥狀Fig.1 Yelllowing symptoms of Huyou

2.2DAS-ELISA檢測

用DAS-ELISA對采集的18個植株表現黃化癥狀的胡柚進行了檢測,結果表明除CS-3、CS-6和QZ-7外,其余15個樣品與CTV抗血清均有反應。其中,CS-7與CTV抗體的反應最強(OD值為3.783),約為陽性對照的3倍,其余樣品與CTV抗體的反應較弱(見表2)。表明,胡柚黃化病可能與CTV病毒有關。為進一步明確感染胡柚的CTV株系,我們對CS-7樣品進行了進一步的分析。

2.3RT-PCR擴增

用CP3進行反轉錄后,用CP1和CP3進行PCR擴增。瓊脂糖凝膠電泳結果顯示擴增的目的條帶約700 bp,與預期條帶大小一致(見圖2)。PCR產物經純化、克隆、測序分析發現,擴增至目的片段長672 bp(GenBank登陸號:HQ634290)。Blastn同源性搜索結果表明該片段與CTV P09.18分離物(GQ424346)的CP基因具最高相似性,為97.17%[8]。

表2 胡柚樣品的DAS-ELISA檢測Table 2 DAS-ELISA detection results of different Huyou samples

圖2 CS-7樣品的RT-PCR檢測Fig.2 RT-PCR detection of CS-7

2.4 同源性分析

將克隆的CS-7 CP基因與CTV GenBank中的其他CTV分離物的相應序列用Clustal X 1.83程序進行多序列比對后進行同源性分析。結果表明,在核苷酸水平上,CS-7與P09.18相似性最高(97.0%),其次分別是 NZRB-TH30(96.8%)、NZRB-M17(96.6%)、NZRB-M12(96.5%)、NZRBTH28(96.5%);在氨基酸水平上,CS-7與P09.18、NZRB-TH30、NZRB-M17、NZRB-M12 和 NZRBTH28的相似性都為96.6%(見表3)。表明CS-7與P09.18、NZRB-TH30、NZRB-M17、NZRB-M12 和NZRB-TH28具有較近的遺傳關系。

表3 CS-7 major CP的核苷酸及氨基酸序列與CTV不同分離物之間相似性比較Table 3 Similarity between nucleotide and amino acid sequences of major CP of CS-7 and other CTV isolates

2.5 系統進化分析

將克隆的CTV CS-7分離物的CP基因與GenBank中的其他CTV分離物的相應序列用MEGA 4.0程序構建系統進化樹(見圖3)。在系統進化樹中,CS-7與P09.18聚于一小分支后再與NZRB-TH28、NZRB-M17、NZRB-M12 和 NZRBTH30 4個分離物形成一個單獨的分支,進一步表明 CS-7 與 P09.18、NZRB-TH30、NZRB-M17、NZRB-M12和NZRB-TH28具有較近的進化關系。

圖3 CS-7與其他CTV分離物構建的系統進化樹Fig.3 Phylogenetic tree of CS-7 and other CTV isolates

3 討論

CTV屬于長線型病毒科(Closteroviridae)長線型病毒屬(Closterovirus),是世界范圍內危害最強、經濟意義最為重要的柑橘病害之一[9]。該病毒在我國也普遍發生,全國幾乎所有的柑橘種植區都有該病毒發生與為害的報道[10-14]。CTV的寄主范圍僅限于蕓香科植物,研究表明CTV可侵染絕大多數栽培的柑橘品種。但是,胡柚上至今還未見有CTV分布與為害的報道。本研究首次從血清學和分子水平證實了CTV病毒在胡柚上的存在,表明胡柚也是CTV的寄主之一。

根據對寄主植物造成的癥狀,CTV可粗分為4個株系:莖陷點株系(Stem-pitting,SP)、衰退株系(Decline inducing,DI)、苗黃化株系(Seedling yellows,SY)和弱癥狀株系[9,15]。其中 SP 株系以分離物VT為代表,DI株系以T30為代表,SY株系以T36為代表。王洪祥等對浙江省黃巖的“本地早”(Citrus succosa)密柑上的CTV進行了研究[16],結果表明CTV在“本地早”發生相當普遍,株莖陷點株系、衰退株系和苗黃化株系都有存在,并且發現苗黃株系或強莖陷點株系和碎葉病毒存在復合感染,這是造成黃巖本地早和新本1號產量低下的一個重要原因。在系統進化樹中本文分離的CTV株系(CS-7)與上述株系都有較遠的遺傳距離,而與P09.18、NZRB-TH28、NZRB-M17、NZRB-M12 和NZRB-TH30聚于一分支,表明CS-7可能是CTV一個新的可誘導胡柚植株黃化癥狀的株系。CTV P09.18分離自美國的California,而NZRB-TH30、NZRB-M17、NZRB-M12和NZRB-TH28來自于新西蘭。由于柑橘起源于我國及東南亞等地區,因此P09.18和NZRB-TH30等美國和新西蘭的CTV可能通過柑橘及其種苗等的貿易被傳入。

在血清學檢測中,不同的分離物與抗血清有著不同的反應,表明侵染胡柚的CTV可能也由不同的株系存在,并且可能存在復合侵染現象。因此,有必要擴大樣品采集范圍,對胡柚上CTV的株系組成以及為害進行更系統的研究,為胡柚黃斑病的防治提供理論基礎。雖然,我們從植株表現黃化的胡柚中檢測到了CTV病毒,但是胡柚植株黃化癥狀是否由CTV引起,還有待將該分離物接種至健康胡柚幼苗并完成柯赫氏法則鑒定,但是這最少需要1~2年的時間才可能有結果。

*武小霞為本文的同等貢獻者。

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