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3 株酵母菌的鑒定及用于水果采后保鮮初探

2024-03-01 09:24:10宋培勇漆楊菊王雙雙
關(guān)鍵詞:酵母菌差異

宋培勇,張 容,漆楊菊,胡 蓉,王雙雙,曾 鋼

(1.遵義師范學(xué)院生物與農(nóng)業(yè)科技學(xué)院,貴州 遵義 563006;2.遵義市第八中學(xué),貴州 遵義 563099)

酵母菌是單細(xì)胞真核微生物,能發(fā)酵糖類產(chǎn)能,故有“糖菌”之稱,以出芽生殖為主,細(xì)胞壁含葡聚糖和甘露聚糖,常常分布在含糖量較高的酸性環(huán)境中。人類與酵母菌關(guān)系久遠(yuǎn)而密切,如白酒的釀造、面包的制作、B 族維生素和單細(xì)胞蛋白(SCP)的生產(chǎn)、石油脫蠟、美容抗衰、疫苗生產(chǎn)等。酵母菌除了上述諸多用途外,在生物保鮮方面,酵母作為主要的生物拮抗菌,因不產(chǎn)生毒素、遺傳穩(wěn)定、生長(zhǎng)繁殖能力強(qiáng)、可與化學(xué)拮抗劑配合使用等特點(diǎn)而成為研究熱點(diǎn)[1,2]。目前,運(yùn)用到果蔬采后病害防治中的拮抗酵母菌約有20 多種,如季也蒙畢赤酵母、羅倫隱球酵母、假絲酵母、隱球酵母、紅酵母、季氏假絲酵母、畢赤酵母、檸檬形克勒克酵母等[3]。應(yīng)用生物拮抗菌對(duì)果蔬采后病害進(jìn)行生物防治是目前最有希望替代化學(xué)殺菌劑的一種新型保鮮技術(shù)[4]。在人類基因組計(jì)劃的推動(dòng)下,1996 年釀酒酵母全基因組測(cè)序完成[5];2018 年中、美科學(xué)家更是利用基因編輯技術(shù)各自人工合成了僅有1 條和2 條染色體的釀酒酵母[6,7]。這些研究極大地推動(dòng)了酵母菌基因組學(xué)和后基因組學(xué)的發(fā)展,也為未來(lái)通過(guò)基因工程改造現(xiàn)有拮抗酵母菌,并最終獲得高效廣譜拮抗酵母菌株提供了可能。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 實(shí)驗(yàn)材料:酵母菌XRL-1、XRL-2 和XRL-3,為本實(shí)驗(yàn)室從貴州省鳳岡縣仙人嶺采集的水果梨、李和葡萄中分離、純化并保存。用于測(cè)試生物保鮮效果的水果棗和提子從當(dāng)?shù)厥袌?chǎng)購(gòu)買(mǎi),山桃從遵義師范學(xué)院校園中采集。

1.1.2 主要儀器:E200F 型生物數(shù)碼顯微鏡(尼康)、Mastercycler nexus gradient 梯度PCR 儀(Eppendorf)、超低溫冰箱(BioRad)、PHS-25 型數(shù)顯PH 計(jì)(上海儀電科學(xué)儀器股份有限公司)、DYY-6C電泳儀(北京六一)。

1.1.3 主要藥品及試劑:PCR引物NL1:5′-GCATATCAATAAGCGGAGGAAAAG-3′和NL4:5′-GGTC CGTGTTTCAAGACGG-3′(上海生工),100 bp DNA Ladde(r北京天根),Taq PCR Mix(2×()上海生工)。

1.1.4 主要培養(yǎng)基:YEPD 培養(yǎng)基、麥?zhǔn)希∕eClary)培養(yǎng)基、碳源同化基礎(chǔ)培養(yǎng)基和氮源同化基礎(chǔ)培養(yǎng)基,參考相關(guān)文獻(xiàn)[8~10]進(jìn)行配制。

1.2 方法

1.2.1 酵母菌形態(tài)特征的觀察

(1)菌落形態(tài):將斜面保存的XRL-1、XRL-2 和XRL-3,無(wú)菌操作轉(zhuǎn)接到Y(jié)EPD 平板上,28 ℃培養(yǎng)3 d-5 d,觀察菌落大小、顏色等形態(tài)特征。

(2)細(xì)胞形態(tài):用接種環(huán)挑取少許酵母菌于滴有無(wú)菌水的載玻片上,涂勻,加蓋玻片,在微分干涉顯微鏡下觀察,并拍照記錄。

(3)子囊孢子:無(wú)菌操作將酵母菌轉(zhuǎn)接到麥?zhǔn)檄傊囵B(yǎng)基上,28 ℃培養(yǎng)48 h 后,挑取少許酵母菌于滴有生理鹽水的載玻片上,混勻,火焰上方固定,自然風(fēng)干,以孔雀綠-番紅染色法染色后,在普通復(fù)式光學(xué)顯微鏡或微分干涉顯微鏡下觀察,拍照并記錄結(jié)果。

1.2.3 生理生化特性

(1)碳源同化/糖發(fā)酵試驗(yàn)。液體培養(yǎng)基的配制:蛋白胨1 g、氯化鈉0.5 g、糖(淀粉/乳糖/葡萄糖/蔗糖)1 g、蒸餾水100 mL,pH7.6,113 ℃滅菌30 min。在超凈工作臺(tái)中制作酵母菌懸液,以移液槍接種1 mL 酵母菌懸液于含不同碳源的蛋白胨培養(yǎng)液試管中(內(nèi)有倒置德漢氏小管),每種碳源各設(shè)3 管,另加有各種碳源的培養(yǎng)液各設(shè)一不接菌種的試管作為對(duì)照組,每一試管中滴入2~3 滴1.6%溴甲酚紫乙醇溶液指示劑,用PHS-25 型數(shù)顯pH 酸堿計(jì)測(cè)量后,以1% NaOH 調(diào)pH 至7.6,并做好標(biāo)記,28 ℃培養(yǎng)2~3天。試管中顏色為紫色不產(chǎn)酸,黃色則產(chǎn)酸;德漢氏小管中有氣泡則證明能產(chǎn)氣,反之則不能。

(2)氮源同化試驗(yàn)。配制氮源同化培養(yǎng)基:硫酸銨0.198 g/尿素0.090 g/蛋白胨3 g/硝酸鈉0.127 g,葡萄糖10 g,磷酸二氫鉀0.2 g,七水合硫酸鎂0.2 g,蒸餾水1000 mL,氯化鈉0.2 g,碳酸鈣5 g,瓊脂15~20 g,調(diào)節(jié)至pH7.0~7.2,121 ℃滅菌20 min,將菌株接種于平板上,每種菌接3 個(gè)平板,28℃培養(yǎng)3~7天。觀察菌株生長(zhǎng)情況。

1.2.4 模板制備和PCR 擴(kuò)增

(1)酵母菌基因組DNA 模板制備[11]挑取酵母菌接種于YEPD平板上,28℃培養(yǎng)2 天,經(jīng)4℃過(guò)夜后,按文獻(xiàn)報(bào)道的方法制備DNA 模板,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

(2)26S rDNA D1/D2 區(qū)PCR 擴(kuò)增

PCR 擴(kuò)增引物為通用引物[12]:NL-1 和NL-4。

PCR 擴(kuò)增程序[13]:94 ℃3 min;94 ℃40 s,48 ℃45 s,72 ℃45 s,5 個(gè)循環(huán);94 ℃40 s,53 ℃45 s,72℃45 s,25 個(gè)循環(huán);72 ℃8 min。

1.2.5 PCR 產(chǎn)物測(cè)序及系統(tǒng)發(fā)育分析

將PCR 產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序(由上海生工完成),將測(cè)序結(jié)果在NCBI 中進(jìn)行Blast 比對(duì)分析,獲得最相近菌株的26S rDNA D1/D2 序列,在MEGA4.1 中以鄰接法(Neighbor-joining)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。

根據(jù)26S rDNA D1/D2 序列比對(duì)和系統(tǒng)發(fā)育分析,并結(jié)合形態(tài)學(xué)和生理生化特征[9,14],對(duì)實(shí)驗(yàn)菌株進(jìn)行分類鑒定。

1.2.6 水果生物保鮮試驗(yàn)

選取3 種水果棗子、提子和山桃,每種水果,設(shè)3 個(gè)試驗(yàn)組(即XRL-1、XRL-2 和XRL-3 處理組)和1 個(gè)對(duì)照組(即無(wú)菌水處理組),每個(gè)組設(shè)3 個(gè)重復(fù),每個(gè)重復(fù)5 個(gè)水果。將XRL-1、XRL-2 和XRL-3 酵母菌YEPD 液體培養(yǎng)物先測(cè)其OD600值,用無(wú)菌水稀釋使各OD600值一致,用無(wú)菌燒杯分裝,將水果放于盛有酵母菌液的燒杯中浸1 min,整齊擺放在臺(tái)面上指定位置,然后連續(xù)觀察記錄2 周,以比較酵母菌對(duì)水果的保鮮效果,并利用SPSS 統(tǒng)計(jì)軟件(IBM SPSS Statistics 19)對(duì)試驗(yàn)結(jié)果做單因素方差分析[15]。

2 結(jié)果與討論

2.1 酵母菌的形態(tài)特征

XRL-1 菌落表面濕潤(rùn)光滑,乳白色,大而厚,圓形,邊緣整齊1.3mm;呈單個(gè)細(xì)胞,圓形或橢圓形,長(zhǎng)4.3m、寬3.7m;在YEPD培養(yǎng)基上可見(jiàn)芽殖;在麥?zhǔn)吓囵B(yǎng)基上未見(jiàn)子囊孢子,見(jiàn)圖1。

圖1 XRL-1 菌落形態(tài)及細(xì)胞形態(tài)(10×100)

XRL -2 菌落表面濕潤(rùn)粘稠,乳白色,圓形或橢圓形,少數(shù)形狀不規(guī)則,從培養(yǎng)基表面微微凸起,邊緣整齊或不整齊2.6mm;呈單個(gè)細(xì)胞,圓形或橢圓形,少數(shù)呈扇形,長(zhǎng)平均5.4m,寬平均4.2m;在YEPD 培養(yǎng)基上可見(jiàn)芽殖;在麥?zhǔn)吓囵B(yǎng)基上見(jiàn)子囊孢子,見(jiàn)圖2。

圖2 XRL-2 子囊孢子(10×100)

XRL-3 菌落表面濕潤(rùn)光滑有光澤,乳白色,圓形或橢圓形,明顯突起,邊緣不整齊2.4mm;細(xì)胞呈檸檬形或卵圓形;在YEPD培養(yǎng)基上可見(jiàn)兩極芽殖,在麥?zhǔn)吓囵B(yǎng)基上未見(jiàn)子囊孢子。

2.2 生理生化特性

碳源同化/糖發(fā)酵試驗(yàn)結(jié)果表明:4 種供試碳源葡萄糖、乳糖、蔗糖和淀粉,XRL-1 均能利用;XRL-2只能利用葡萄糖和蔗糖;XRL-3 只能利用葡萄糖、乳糖和蔗糖,但對(duì)蔗糖利用作用不如葡萄糖和乳糖;葡萄糖是3 株酵母菌均能利用的通用碳源,見(jiàn)表1。

表1 碳源同化/糖發(fā)酵及氮源同化結(jié)果

氮源同化試驗(yàn)結(jié)果表明:4 種供試氮源蛋白胨、尿素、硝酸鈉和硫酸銨,XRL-1 和XRL-2 菌株均能利用,但XRL-3 僅能利用蛋白胨,蛋白胨是3 株酵母菌的通用氮源,見(jiàn)表1。

2.3 26S rDNA D1/D2 區(qū)PCR 擴(kuò)增、測(cè)序、比對(duì)及系統(tǒng)發(fā)育分析

利用26S rDNA D1/D2 區(qū)PCR 擴(kuò)增通用引物NL1 和NL4 進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物用1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),結(jié)果如圖3 所示:XRL-1、XRL-2和XRL-3 均擴(kuò)增到約600 bp 大小的片段,條帶清晰、整齊、明亮,與有關(guān)文獻(xiàn)[16,17]報(bào)道的一致,說(shuō)明已成功擴(kuò)增到了目的片段。

圖3 酵母菌26S rDNA D1/D2 區(qū)PCR 擴(kuò)增

將PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物測(cè)序,進(jìn)入NCBI 官網(wǎng)進(jìn)行Blast 比對(duì),結(jié)果如表2 所示:XRL-1 與Wickerhamomyces anomalus strain FBKL2.8007 相似性為100.00%,XRL-2 與Saccharomyces cerevisiae isolate LMQA SNR 106 的相似性為99.83%,XRL-3 與Hanseniaspora uvarum strain SC-12 的相似性為99.66%。

表2 26S rDNA D1/D2 區(qū)PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物BLAST 比對(duì)結(jié)果

利用XRL-1、XRL-2 和XRL-3 的26S rDNA D1/D2 區(qū)序列和 Wickerhamomyces anomalus strain FBKL2.8007、Saccharomyces cerevisiae isolate LMQA SNR 106 和 Hanseniaspora uvarum strain SC-12 的相應(yīng)序列,利用Mega4.1 構(gòu)樹(shù)軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),結(jié)果如圖4 所示,XRL-1、XRL-2和XRL-3與相應(yīng)的同源菌株聚為一支,同時(shí)也可以看出,在3株酵母菌中,XRL-2 和XRL-3 親緣關(guān)系更近。

圖4 根據(jù)酵母菌26S rDNA D1/D2 區(qū)序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)

根據(jù)26S rDNA D1/D2 區(qū)序列Blast 比對(duì)和系統(tǒng)發(fā)育分析,結(jié)合形態(tài)學(xué)和生理生化特征,將試驗(yàn)菌株XRL-1、XRL-2 和XRL-3 分別鑒定為異常威克漢姆酵母(Wickerhamomyces anomalus )、釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)和葡萄汁有孢漢遜酵母(Hanseniaspora uvarum)。

2.4 水果生物保鮮

水果保鮮結(jié)果如表3 所示,單因素方差分析表明:酵母菌XRL-1、XRL-2 和XRL-3 對(duì)棗子、提子和山桃的保鮮效果在第一周均無(wú)顯著性差異(p>0.05);在第二周對(duì)山桃亦無(wú)顯著差異(p>0.05),但對(duì)棗子和提子差異顯著(p<0.05),就棗子保鮮效果而言,多重比較表明XRL-1、XRL-2 和XRL-3 與對(duì)照組之間以及XRL-1 與XRL-2 和XRL-3 之間差異顯著(p<0.05),XRL-2 與 XRL-3 之間差異不顯著(p>0.05);就提子的保鮮效果而言,多重比較表明XRL-1 與XRL-3 和對(duì)照組之間差異顯著(p<0.05),但XRL-1 與XRL-2 以及XRL-2 與對(duì)照組和XRL-3之間差異不顯著。提示不同的酵母菌拮抗活性存在明顯差異,3 種酵母菌中以異常威克漢姆酵母對(duì)棗子和提子的保鮮效果在第二周最佳,這與王遠(yuǎn)見(jiàn)(2022)[18]和藍(lán)黃博恩(2023)[19]報(bào)道的比較一致;第一周無(wú)顯著性差異可能和酵母菌的接種方法及其水果的定植有關(guān)。而山桃無(wú)論在第一周還是第二周,3 種酵母菌的保鮮效果并無(wú)顯著差異,推斷可能因?yàn)樯教沂且吧又煌乃赡艽嬖诓煌奈⑸飬^(qū)系,引起水果褐變或霉變的致病菌不同,水果中各種抗性酶的活性亦有高低,致使酵母菌對(duì)不同水果的保鮮效果各異。

表3 3 株酵母菌對(duì)3 種水果的生物保鮮效果(表中數(shù)據(jù)為褐變或霉變率/%)

3 結(jié)論

對(duì)從貴州省鳳岡縣仙人嶺李、梨和葡萄3 種水果中分離的3 株酵母菌XRL-1、XRL-2 和XRL-3 開(kāi)展了形態(tài)學(xué)、生理生化以及分子生物學(xué)鑒定,將XRL-1、XRL-2 和XRL-3 分別鑒定為異常威克漢姆酵母(Wickerhamomyces anomalus)、釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)和葡萄汁有孢漢遜酵母(Hanseniaspora uvarum)。3 株酵母菌對(duì)水果棗子、提子和山桃采后保鮮的效果并不一致:在棗子采后保鮮上,XRL-1 與XRL-2、XRL-3 與對(duì)照組相比,在第一周無(wú)顯著性差異,但在第二周差異顯著(p<0.05);在提子采后保鮮上,XRL-1、XRL-2 和XRL-3 與對(duì)照組相比,在第一周無(wú)顯著性差異,但在第二周XRL-1 與XRL-3 和對(duì)照組之間差異顯著(p<0.05);在山桃采后保鮮上,XRL-1、XRL-2 和XRL-3 與對(duì)照組相比,在第一周和第二周均無(wú)顯著性差異(p>0.05)。用酵母菌作為拮抗菌劑用于果蔬生物保鮮,尚需要進(jìn)一步深入開(kāi)展以下研究:拮抗酵母篩選與基因工程改良,拮抗酵母復(fù)合菌劑研究,果蔬采后微生物區(qū)系變化研究等。

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