李書,唐玉蓮,孫麗雙,李根亮
(1. 右江民族醫(yī)學院研究生學院,廣西 百色 533000;2. 右江民族醫(yī)學院醫(yī)學檢驗學院,廣西 百色 533000;3. 右江民族醫(yī)學院基礎醫(yī)學院,廣西 百色 533000)
肝細胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是發(fā)生在肝細胞的惡性腫瘤,是世界第五大常見癌癥和第四大癌癥相關(guān)死亡原因。HCC具有極高的發(fā)病率和致死率,且易轉(zhuǎn)移和復發(fā),發(fā)病機制具有復雜性和異質(zhì)性,很難徹底明確其致病過程。但經(jīng)研究發(fā)現(xiàn)在HCC發(fā)生與轉(zhuǎn)移過程中與腫瘤相關(guān)的蛋白基因都產(chǎn)生異常表達情況,研究其發(fā)生與表達量的變化可能為HCC的診斷治療提供新靶點。同時明確靶向調(diào)控基因的miRNA和ceRNA調(diào)控網(wǎng)絡有助于進一步提供研究異常基因表達機制的方向。
硫酸乙酰肝素蛋白聚糖2(heparan sulfate proteoglycan 2,Hspg2)位于第四號染色體上,是細胞外基質(zhì)的重要成分,在基質(zhì)和基膜中形成屏障結(jié)構(gòu),是生物信號分子的儲存庫。Hspg由一個核心蛋白,一個或多個硫酸化的糖胺聚糖和硫酸乙酰肝素鏈聚合而成的[1]。其中Hspg2存在EGF樣結(jié)構(gòu)域和層粘連蛋白結(jié)構(gòu)域,可以通過與相關(guān)分子結(jié)合進而對細胞分化,運動以及對維持組織表型和促進組織存活起到關(guān)鍵作用。目前有關(guān)Hspg2的研究主要集中在血管生成以及神經(jīng)系統(tǒng)疾病等方面[2-5],而對HCC的發(fā)生發(fā)展以及調(diào)控該基因的相關(guān)miRNA和ceRNA的研究甚少。
據(jù)此,本課題通過全轉(zhuǎn)錄組測序和實時熒光定量PCR(real-time fluorescence quantitative PCR,RT-qPCR),檢測Hspg2基因在不同發(fā)展階段肝組織和HCC組織的相對表達情況,并通過深圳華大基因的Dr.Tom多組學交互系統(tǒng),分析全轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中參與調(diào)控Hspg2的相關(guān)miRNA、ceRNA和PPI,分析Hspg2在HCC組織中過表達的可能分子機制。……