銅死亡相關(guān)配對(duì)長(zhǎng)鏈非編碼RNA肺腺癌預(yù)后模型的構(gòu)建

劉雅峰，魯繼斌

（中國醫(yī)科大學(xué)附屬盛京醫(yī)院胸外科，沈陽 110004）

肺癌是全球癌癥死亡的最主要原因。在我國，其發(fā)病率和死亡率亦位于惡性腫瘤之首［1］。肺腺癌屬于非小細(xì)胞肺癌，是肺癌最常見的病理類型，約占肺癌整體的40%［2］。分子靶向治療和免疫治療已經(jīng)成為肺腺癌的常規(guī)治療手段，使其預(yù)后有所改善，但我國肺癌患者總體5年生存率仍小于20%。因此，尋找預(yù)測(cè)肺癌預(yù)后的生物標(biāo)志物十分必要。

銅是生物體必需的微量元素。但當(dāng)細(xì)胞內(nèi)的銅離子濃度超過穩(wěn)態(tài)閾值時(shí)，會(huì)表現(xiàn)出細(xì)胞毒性。銅死亡是一種新型細(xì)胞程序性死亡，其原理為過量的銅離子直接與三羧酸循環(huán)中的脂酰化成分結(jié)合，誘導(dǎo)脂酰化蛋白質(zhì)聚集和鐵硫簇蛋白質(zhì)丟失，激發(fā)蛋白質(zhì)毒性應(yīng)激，從而導(dǎo)致細(xì)胞死亡［3］。已有研究［4］表明，銅離子與腫瘤的生長(zhǎng)、增殖和抗血管生成等密切相關(guān)。

長(zhǎng)鏈非編碼RNA （long noncoding RNA，lncRNA）是一種長(zhǎng)度超過200個(gè)核苷酸的非編碼RNA。許多研究［5-6］證實(shí)，lncRNA可以調(diào)控肺腺癌的生物學(xué)行為，還可以作為預(yù)測(cè)肺腺癌預(yù)后等的潛在生物標(biāo)志物。本研究旨在開發(fā)新型銅死亡相關(guān)配對(duì)lncRNA的預(yù)后標(biāo)志物，以期提高預(yù)測(cè)肺腺癌患者預(yù)后的準(zhǔn)確性以及評(píng)估其藥物敏感性。

1 材料與方法

1.1 數(shù)據(jù)的獲取和確定銅死亡相關(guān)差異lncRNA（differentially expressed cuproptosis-related lncRNA，DEcrlncRNA）

由癌癥基因組圖譜 （The Cancer Genome Atlas，TCGA） 數(shù)據(jù)庫獲取肺腺癌患者轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)、基因突變信息和對(duì)應(yīng)的臨床信息。使用Ensembl數(shù)據(jù)庫來源的注釋文件，注釋其中的lncRNA。從已有文獻(xiàn)中獲取共10個(gè)銅死亡相關(guān)基因，包括FDX1、LIAS、LIPT1、DLD、DLAT、PDHA1、PDHB、MTF1、GLS和CDKN2A。……