基于高通量測序肺腺癌個體化新抗原預(yù)測結(jié)果分析

秦續(xù)元,周平平,宋 旸,杜珍武*,張桂珍,*

(1.長春腫瘤醫(yī)院基因檢測中心,吉林 長春130013;2.吉林大學(xué)第二醫(yī)院骨科醫(yī)院,吉林 長春130041)

腫瘤新抗原(Tumor Neoantigen)又稱為腫瘤特異性抗原,該抗原只在腫瘤細(xì)胞內(nèi)表達(dá)而在正常細(xì)胞內(nèi)不表達(dá),并能被人白細(xì)胞分化抗原(HLA)I類分子識別、結(jié)合并遞呈到腫瘤細(xì)胞表面,激活特異性T淋巴細(xì)胞,引發(fā)機(jī)體抗腫瘤免疫反應(yīng)[1]。由于腫瘤患病個體異質(zhì)性導(dǎo)致腫瘤新抗原具有個體化特點,由此以腫瘤新抗原為靶點為腫瘤個體化免疫治療提供了科學(xué)性和可行性。基于新抗原開發(fā)的抗腫瘤的RNA、肽疫苗以及樹突細(xì)胞疫苗已在黑色素瘤[2-3]、膠質(zhì)瘤[4]、乳腺癌[5]、肝癌[6]及前列腺癌[7]等的臨床應(yīng)用研究中顯示出良好的治療效果,提示腫瘤新抗原在腫瘤治療中具有的潛在應(yīng)用價值。

肺癌是我國發(fā)病率及死亡率居首位的惡性腫瘤。肺腺癌是肺癌中最為常見的病理分型[8],其分子突變譜不僅含有當(dāng)前靶向治療藥物治療的主要靶點[9],也具有較高的腫瘤特異性突變負(fù)荷[10-11],近期兩項基于腫瘤新抗原技術(shù)對于進(jìn)展期肺腺癌治療的臨床研究結(jié)果顯示了具有良好的治療效果,提示該技術(shù)在肺腺癌治療的應(yīng)用價值[12-13],這些研究結(jié)果將加速腫瘤新抗原在肺腺癌臨床治療的研究進(jìn)程。

目前,腫瘤新抗原的發(fā)現(xiàn)主要是采用全外顯子高通量測序篩選出腫瘤細(xì)胞特異性基因突變并結(jié)合其轉(zhuǎn)錄組測序中的基因表達(dá)水平,再通過免疫抗原數(shù)據(jù)庫預(yù)測與人類白細(xì)胞抗原(HLA) I類分子的親和力,具有高親和力的肽段體外負(fù)載樹突細(xì)胞,測定激活淋巴細(xì)胞的能力,評估新抗原肽段的免疫原性與抗腫瘤效果[14]。……