長春市2016—2020監(jiān)測年度甲型H1N1流感病毒血凝素(HA)基因特征分析

崔 薇,初 秋,李晨光,龔云偉,趙春艷,孫 宇,隋天卓,孫炳欣*

(1.長春市疾病預(yù)防控制中心,吉林 長春130033;2.吉林大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院,吉林 長春130021)

流感病毒是有包膜的負(fù)鏈RNA病毒,其中甲型流感整個(gè)基因組分成8個(gè)節(jié)段,分別編碼PB2,PB1,PA,HA,NP,NA,M,NS等蛋白,每種蛋白在流感病毒感染、增殖、釋放、擴(kuò)散及傳播過程中都行使不同的功能。其中血凝素(HA),它在流感病毒受體識(shí)別和入侵過程中起著重要的作用,同時(shí)能誘導(dǎo)機(jī)體產(chǎn)生中和抗體[1]。HA還是流感病毒容易發(fā)生變異的抗原,進(jìn)而導(dǎo)致流感逃避宿主的免疫的識(shí)別與清除,從而引起流感的反復(fù)流行,因此對流感病毒抗原進(jìn)化和疫苗選擇的研究也主要集中在HA重要的氨基酸位點(diǎn)上。

為了解長春市甲型H1N1血凝素(HA)基因特征,我們對2016-2020年度甲型H1N1血凝素(HA)變異情況及進(jìn)化特征進(jìn)行了分析,為長春市甲型H1N1流感防控及預(yù)測提供參考依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 標(biāo)本來源

按照《全國流感監(jiān)測方案(2017版)》要求,長春市3家流感監(jiān)測哨點(diǎn)醫(yī)院對發(fā)熱3天內(nèi)流感樣病例(體溫≥38℃,伴咳嗽或咽痛之一)進(jìn)行標(biāo)本采集。長春市CDC流感網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室對這些流感樣病例標(biāo)本進(jìn)行核酸檢測,并對其中流感病毒陽性標(biāo)本進(jìn)行病毒分離,獲得流感病毒毒株。本次研究選取長春市2016-2020年期間共4個(gè)監(jiān)測年度的流感毒株109株,所有毒株均由長春CDC流感網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室分離鑒定。

1.2 甲型H1N1流感病毒毒株核酸提取和HA基因擴(kuò)增

用碩世病毒核酸快速提取試劑盒提取流感病毒毒株RNA,將提取到的病毒RNA先反轉(zhuǎn)錄成cDNA,再用設(shè)計(jì)的引物進(jìn)行血凝素(HA)基因擴(kuò)增,對PCR產(chǎn)物用毛細(xì)管電泳方法進(jìn)行確認(rèn)。……