陳振艷,張相琴,陳蘭,謝思藝,劉碩謙,2*,田娜,2*
茶樹基因家族的鑒定及表達分析
陳振艷1,張相琴1,陳蘭1,謝思藝1,劉碩謙1,2*,田娜1,2*
1. 湖南農業大學園藝學院茶學教育部重點實驗室,湖南 長沙 410128;2. 湖南農業大學園藝學院茶學系,湖南 長沙 410128
NUDIX水解酶屬于焦磷酸酶,在信息傳遞、植物生長協調和響應逆境脅迫等方面起著重要作用。基于茶樹()基因組鑒定出43個家族基因,并運用生物信息學和實時熒光定量PCR等方法對其分析。結果表明,43個CsNUDXs蛋白質分子量介于11.8~89.2?kDa,氨基酸長度為102~342個,理論等電點為4.49~9.26,18.6%的蛋白為穩定性蛋白;根據進化關系將分為6個亞家族;啟動子順式作用元件分析發現具有許多與激素響應、逆境脅迫和生長發育等調控相關的作用元件;對家族基因在不同器官表達模式進行分析,發現、在果實中表達量較高,而、在果實中表達量極低,在老葉中表達量極低;不同處理組的實時熒光定量PCR結果表明,1?mmol·L-1茉莉酸甲酯(MeJA)處理下、和等表達量呈現先升后降再升的趨勢,而1?mmol·L-1水楊酸(SA)處理下、和等表達量則呈現先降后升再降的趨勢,300?mmol·L-1NaCl處理下和等表達量呈現先升后降的趨勢。本研究應用生物信息學技術初步解析了的基本特征和功能,發現可響應高鹽脅迫和MeJA、SA處理。
茶樹;基因家族;非生物脅迫;表達分析
NUDIX水解酶(Nucleoside diphosphate linked to x hydrolases)是一類能夠催化水解核苷糖、二核苷多聚磷酸鹽和三磷酸核苷等多類有機焦磷酸鹽的焦磷酸酶[1],廣泛分布在生物體內。大腸桿菌中MutT(NudA)是最早被發現的NUDIX水解酶,故NUDIX水解酶家族又被稱為MutT家族[2]。……