聯合免疫相關性lncRNA和臨床病理學特征建立腎透明細胞癌的預后模型

葉碩鵬 林登強 陳凌宇 賴鵬

腎透明細胞癌(clear cell renal cell carcinoma, ccRCC)是腎小管上皮來源最常見的腎臟惡性腫瘤，全球每年新發ccRCC病例約為29.5萬人，相關死亡人數達13.4萬人[1]。盡管目前局部進展和晚期ccRCC的治療已從非特異性免疫方法轉變為新型免疫療法，但這類患者預后仍然較差[2]。因此，我們亟需尋找新型有效的ccRCC腫瘤標志物去協助臨床醫師診斷、指導治療、評估并改善患者預后。

在人類基因組中，參與編碼蛋白的RNAs僅占基因組的1%～2%，既往研究主要集中于此，而高達98%的非編碼RNA(non-coding RNA, ncRNA)同樣具備調控細胞復制、細胞特點及細胞功能的作用，并在腫瘤免疫應答過程中發揮至關重要的作用，如抗原暴露、抗原識別、免疫激活、免疫浸潤、腫瘤清除等[3]。長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA, lncRNA)作為ncRNA的一大類，相關研究已證實其不僅在腫瘤中異常表達，而且參與腫瘤的發生、發展，有望成為腫瘤診斷或治療的分子標志物[4]。

近來研究表明lncRNA與ccRCC的發生、發展密切相關，其可能通過調控免疫浸潤、免疫功能等影響ccRCC的臨床預后[5]。因此，我們基于免疫相關的lncRNA，納入臨床病理學信息，構建包含lncRNA風險評分(lncRNA-Score)和臨床病理學信息的聯合預后模型，旨在協助臨床診療,改善ccRCC患者的預后。

材料與方法

一、生物信息學數據來源

ccRCC患者的基因表達譜及相應臨床數據來源于癌癥基因組圖譜(The Cancer Genome Atlas, TCGA)數據庫(https://cancergenome.nih.gov/)，排除沒有完整臨床數據或生存時間≤30 d的患者，共納入539例ccRCC組織數據和72例正常腎臟組織數據。而免疫應答和免疫系統過程基因集來源于基因集富集分析(gene set enrichment analysis, GSEA)數據庫(https://www.gsea-msigdb.org/gsea/msigdb/)。……