高通量測序診斷鸚鵡熱衣原體肺炎六例并文獻復習

任陽 沈一丹 王梅 王雷 李鋒，2

鸚鵡熱衣原體是一種胞內寄生的革蘭陰性病原體，生物學特性介于細菌與病毒之間，也是一種動物傳染性細菌，具有宿主廣泛和傳播途徑復雜等特點[1]。其在全球許多國家和地區都有發現，鳥類、家禽、家畜及野生動物均可感染，經氣溶膠吸入或密切接觸可發生人畜傳染，具有很強致病性，臨床癥狀多樣，不具有特異性。病原菌經肺吸入后，首先入血在肝脾單核巨噬細胞系統內增殖，再血行播散至全身器官，表現為肺、肝、脾、腎臟及中樞神經系統累及，可引起非典型性肺炎、敗血癥、心內膜炎和腦膜炎等[2]，臨床癥狀變異較大，可以長期無癥狀，或以肺部受累為主要表現。肺部受累有時也可僅表現為不明原因發熱，更甚者出現呼吸窘迫和呼吸衰竭，因而臨床快速確診對指導治療具有重要意義。

目前，鸚鵡熱衣原體檢測方法有以下幾種：病原分離鑒定、免疫熒光法、間接血凝抑制試驗、補體結合試驗、酶聯免疫吸附試驗、常規PCR，以及熒光定量PCR等[3]。高通量測序(high-throughput sequencing)又名下一代測序(next generation sequencing，NGS)，是一種新型的微生物檢測技術，具有通量高和成本低的特點。其通過序列比對能夠快速、準確地鑒定出微生物種屬特點，廣泛應用于宏基因組檢測未知病原的研究領域[4]。筆者對6例鸚鵡熱衣原體肺炎患者肺泡灌洗液送檢NGS，以快速診斷，并為臨床抗感染治療提供了明確方向，最終患者均獲得良好轉歸，現報道如下。

臨床資料

一、病史資料

例1患者，男，60歲，因“間斷發熱3 d”于2020年12月30日收治入院。……