基于RNA-seq篩選影響豬肉品質的關鍵候選基因

肖明飛，申露露，何逸懿，易宏波，唐青松，李莉，洪興，李大江，徐娥*

（1.貴州大學動物科學學院，貴州貴陽 550025；2.廣東省農業科學院動物科學研究所，廣東廣州 510640；3.成都通威三新藥業有限公司，四川成都 611500）

豬肉品質是養豬生產中最重要的目標性狀之一。近年來，畜牧行業片面追求豬的生產性能，導致肉的風味變差，肉品質下降。從江香豬是貴州省著名地方小型豬種，屬于國家二級保護畜種。從江香豬具有很強的環境適應性和抗病能力，具有高度純合的基因水平，因肉質細嫩和味道鮮美而聞名。研究表明，從江香豬豬肉屬于高蛋白和低熱能的健康肉類，富含多種人體所必需的營養物質。近年來，轉錄組測序（RNA-seq）技術在畜牧行業得到廣泛應用。張福平等通過RNAseq 發現了與從江香豬發情排卵密切相關的7 個候選基因（和）。María 等基于RNA-seq 研究表明，在純種伊比利亞豬肌內脂肪中301 個轉錄調控因子參與表達差異，其中和參與脂肪生成，和參與骨骼肌的發育。此外，也有學者通過RNA-seq 技術初步證實了miRNA-499 和miRNA-22 是影響豬肉滴水損失性狀的潛在調節因素。然而，目前關于從江香豬背最長肌的基因組學研究較少，從江香豬肉質與大白豬的關鍵功能基因鮮有報道。本研究基于RNA-seq 技術對香豬和大白豬背最長肌的表達譜差異進行分析，通過GO 和KEGG 篩選與豬肉品質相關的信號通路，挖掘影響豬肉品質形成的關鍵功能基因，以期為豬肉品質的改善提供相應的理論依據。

1 材料與方法

1.1 實驗動物及樣品采集 實驗在貴州大學種豬場進行，從江香豬與大白豬屠宰前的飼養管理均一致。……