基于生物信息學分析探討類風濕關節炎與骨關節炎之間的關系①

章曉云 李華南 陳 鋒 柴 源 甘 斌 陳丁鵬 （江西中醫藥大學，南昌 330004）

類風濕關節炎（rheumatoid arthritis，RA）是一種自身免疫性疾病，可引起慢性炎癥表現、肥胖、心血管疾病等，影響全球0.3%～1.0%的人口，在中國每年至少500 萬人被診斷出RA［1-2］。骨關節炎（osteoarthritis，OA）是一系列能引起軟骨損傷和變性的退行性關節炎的總稱，影響了全球約2.4億人口，無論是從生活質量還是疾病負擔方面，都已成為全球范圍內嚴重的公共衛生問題［3-5］。兩者是目前最常見的關節炎類型，病因均未明確，暫無有效的根治方法，給個人和社會帶來了巨大的經濟壓力。

盡管兩種疾病的病因學不同，但均以滑膜炎癥反應、關節軟骨破壞、骨質流失等為特征，最終導致關節進行性退變，臨床上許多患者同時患有這兩種疾病。研究表明RA 是OA 發病的重要危險因素之一，RA 患者罹患OA 的風險比正常人高2.75 倍［4］。隨著基礎研究的不斷深入，已經發現兩種疾病之間存在諸多共同發病機制和受調控因子，在蛋白質水平和組織炎癥評分水平上具有很強的連續性［6-8］。因此，本研究通過GEO數據庫查找RA和OA血清基因芯片表達譜進行生物信息學分析，篩選出差異miRNA 并進行靶基因預測，最后交集篩選出核心mRNA，為確定RA 和OA 之間的共同發病機理創造條件，并為RA 和OA 治療藥物的研發提供有效的作用靶點。

1 資料與方法

1.1 數據收集 以“Rheumatoid arthritis”“Osteoar?thritis”“miRNA”為關鍵詞，在GEO 公共數據庫（https：//www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/）［9］檢索與RA 及OA 相關的芯片，獲得編號為GSE115885 的RA 血清基因表達芯片，共包含15 例RA 患者和5 例健康對照，其所處平臺為GPL25134；獲得編號為GSE105027 的OA 血清基因表達芯片，共含12 例OA患者和12例健康對照，其所處平臺為GPL21575。……