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乳腺癌患者CLCA4的表達(dá)與臨床病理及預(yù)后的關(guān)系*

2022-05-28 04:18:14付立業(yè)孟凡東
中國衛(wèi)生統(tǒng)計 2022年2期
關(guān)鍵詞:乳腺癌水平分析

李 媛 付立業(yè) 孟凡東 張 玲 李 妍 徐 巖

【提 要】 目的 探討CLCA4在乳腺癌患者中的表達(dá)水平,及其與生存預(yù)后的關(guān)系。方法 從TCGA數(shù)據(jù)庫中獲取乳腺癌患者的臨床基本資料,R語言ggplot2包分析CLCA4的表達(dá);survival包用于生存資料的統(tǒng)計分析;卡方檢驗分析CLCA4與臨床病理的關(guān)系。結(jié)果 CLCA4在乳腺癌患者中呈低表達(dá)狀態(tài);CLCA4高表達(dá)的乳腺癌患者具有較好的預(yù)后;CLCA4的表達(dá)水平與乳腺癌患者的T分期和年齡有關(guān)。結(jié)論 CLCA4在乳腺癌患者中低表達(dá),可為尋找乳腺癌早期診斷的標(biāo)志物、治療靶點及預(yù)后分析提供一定的理論基礎(chǔ)。

乳腺癌是女性常見的惡性腫瘤之一,隨著其診斷及治療方法的不斷進(jìn)步,早期治愈率很高,但其發(fā)病率仍呈逐年上升趨勢,嚴(yán)重威脅女性的健康及生命[1-3]。不同類型的乳腺癌具有不同的發(fā)病率、死亡率及對藥物的敏感性。人類基因組文庫中,發(fā)現(xiàn)有三種鈣激活氯通道調(diào)節(jié)蛋白(CLCA)分別是CLCA1、CLCA2和CLCA4[4]。人類CLCA基因位于染色體1p31-1p22中[5]。CLCA4基因在多種腫瘤中都具有重要的臨床意義,但目前關(guān)于CLCA4在乳腺癌中的作用及其機(jī)制研究甚少。尋找有效的診斷標(biāo)志物及治療靶點,對提高乳腺癌患者的生存期具有一定的臨床指導(dǎo)意義。

因此,本研究利用TCGA(the cancer genome atlas)數(shù)據(jù)庫,分析了CLCA4在乳腺癌患者中的表達(dá)情況,預(yù)測其對乳腺癌患者的生存及預(yù)后能力的影響,并進(jìn)一步探討CLCA4基因的表達(dá)與乳腺癌患者的臨床病理之間的關(guān)系。

資料與方法

1.乳腺癌患者臨床數(shù)據(jù)的收集

從TCGA數(shù)據(jù)庫(https://portal.gdc.cancer.gov/)中下載乳腺癌患者臨床數(shù)據(jù),包括乳腺癌患者癌組織標(biāo)本1109例,癌旁組織標(biāo)本113例。其中高表達(dá)組542例,低表達(dá)組540例。在R語言安裝ggplot2包的條件下,分析CLCA4在乳腺癌中的表達(dá)情況,survival包用于生存資料的統(tǒng)計分析[6]。

2.統(tǒng)計學(xué)分析

利用SPSS 22.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計分析。正態(tài)性檢驗,樣本不滿足正態(tài)性檢驗(P<0.05),選擇Mann-WhitneyU檢驗;log-rank檢驗[7]和Cox回歸分析各組的生存時間分布差異;卡方檢驗分析CLCA4與乳腺癌患者臨床病理分期的關(guān)系。P<0.05視為結(jié)果具有統(tǒng)計學(xué)差異。

結(jié) 果

1.CLCA4在乳腺癌患者中的表達(dá)情況

統(tǒng)計分析結(jié)果顯示,與癌旁組織相比,CLCA4在乳腺癌患者中呈低表達(dá)狀態(tài),具有統(tǒng)計學(xué)差異(P<0.01,如圖1A)。為了進(jìn)一步研究CLCA4在乳腺癌中的作用,將乳腺癌患者進(jìn)行分組分析,結(jié)果顯示,≤51歲的乳腺癌患者CLCA4的表達(dá)水平高于>51歲患者(P<0.0001,如圖1B);基底細(xì)胞型乳腺癌患者CLCA4的表達(dá)水平高于非基底細(xì)胞型患者(P<0.0001,如圖1C);ER-乳腺癌患者CLCA4的表達(dá)水平高于ER+患者(P<0.0001,如圖1D);PR-乳腺癌患者CLCA4的表達(dá)水平高于PR+患者(P<0.0001,如圖1E);淋巴結(jié)是否發(fā)生轉(zhuǎn)移對于CLCA4的表達(dá)無影響(P=0.1689,如圖1F);HER2-乳腺癌患者CLCA4的表達(dá)水平高于HER2+患者(P<0.0001,如圖1G);三陰乳腺癌患者CLCA4的表達(dá)水平高于非三陰乳腺癌患者(P<0.0001,如圖1H),差異具有顯著的統(tǒng)計學(xué)意義。

圖1 CLCA4在乳腺癌患者中的表達(dá)

2.乳腺癌患者CLCA4的表達(dá)對預(yù)后的影響

為了分析CLCA4的表達(dá)水平與乳腺癌患者預(yù)后的關(guān)系,本實驗選取了20年生存期做分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn),高表達(dá)CLCA4的乳腺癌患者相比低表達(dá)的患者具有更好的預(yù)后,即CLCA4高表達(dá)與乳腺癌患者20年內(nèi)預(yù)后的生存率相關(guān)(P=0.032,如圖2)。

圖2 CLCA4對乳腺癌患者生存的影響

log-rank檢驗結(jié)果提示,乳腺癌患者和正常對照組的生存時間分布的差異具有統(tǒng)計學(xué)意義,P=0.031;Cox回歸結(jié)果提示,乳腺癌患者和正常對照組的生存時間分布的差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(HR=0.70,P=0.032)。

3.CLCA4對乳腺癌患者的診斷價值

ROC曲線結(jié)果顯示AUC=0.912,表明CLCA4對于乳腺癌的診斷具有一定的臨床價值。

4.乳腺癌患者中CLCA4基因的表達(dá)與臨床病理分型間的關(guān)系

圖3 CLCA對乳腺癌診斷的ROC曲線

表1分析了乳腺癌患者中CLCA4的表達(dá)水平與臨床病理分期之間的關(guān)系,結(jié)果顯示,CLCA4的表達(dá)水平與乳腺癌患者的T分期、年齡有關(guān),與乳腺癌患者的N分期、M分期不相關(guān)。

表1 CLCA4的表達(dá)與乳腺癌患者臨床病理分期的關(guān)系

討 論

盡管乳腺癌的診斷方法和治療手段不斷進(jìn)步,但乳腺癌仍然是威脅女性健康,導(dǎo)致癌癥相關(guān)死亡的常見原因。尋找有效的、低成本的預(yù)測指標(biāo)至關(guān)重要,對于指導(dǎo)臨床的有效治療意義深遠(yuǎn)。CLCA4作為一種抑癌基因,在多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展中具有重要的臨床意義,低表達(dá)的CLCA4促進(jìn)了肝癌細(xì)胞的增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移[8]。生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),CLCA4可以作為口腔癌的一個潛在的治療靶點[9]。對于CLCA4在乳腺癌中的作用研究較少,本研究通過大數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn)CLCA4在乳腺癌中的表達(dá)水平顯著低于正常對照組織,這與其他腫瘤的文獻(xiàn)報道一致,可見CLCA4作為抑癌基因,與乳腺癌患者的生存期也顯著相關(guān),表明CLCA4很可能是乳腺癌的標(biāo)志物并參與了腫瘤的復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移,如果早期檢測該標(biāo)志物,也許可以預(yù)測患者預(yù)后并作為治療干預(yù)的判斷依據(jù)。

有研究發(fā)現(xiàn)CLCA4在上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)中發(fā)揮重要作用[10]。參與許多上皮源性腫瘤的侵襲與轉(zhuǎn)移,對患者的生存及預(yù)后造成很大影響[11-12]。Hou等[13]研究發(fā)現(xiàn)CLCA4可能在膀胱癌的發(fā)生和發(fā)展中起關(guān)鍵作用。臨床分析揭示了CLCA4在膀胱癌中的下調(diào)與膀胱癌患者的預(yù)后不良相關(guān)。CLCA4的下調(diào)增強(qiáng)了膀胱癌細(xì)胞的生長和侵襲能力,而CLCA4的過表達(dá)通過調(diào)節(jié)PI3K/AKT信號傳導(dǎo)降低了這些作用[14]。沉默CLCA4表達(dá)可以降低乳腺癌細(xì)胞中E-cadherin的表達(dá),上調(diào)N-cadherin和Vimentin的表達(dá)[15]。

生存曲線證實CLCA4基因表達(dá)升高的乳腺癌患者,其生存時間明顯高于CLCA4基因表達(dá)降低的患者,表明CLCA4的升高對于乳腺癌具有一定的抑制作用。ROC曲線結(jié)果提示CLCA4對于乳腺癌的預(yù)測能力具有較高的準(zhǔn)確性。CLCA4有望成為評估乳腺癌患者預(yù)后的重要手段。

本研究通過生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),CLCA4在乳腺癌組織中低表達(dá),并且CLCA4的表達(dá)水平與乳腺癌的T分期和年齡存在一定的相關(guān)性。低表達(dá)CLCA4的乳腺癌患者,其生存預(yù)后較差,本文的研究為乳腺癌的發(fā)生發(fā)展、預(yù)后評價及靶向藥物的治療提供了一定的理論基礎(chǔ)。

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