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甲基轉(zhuǎn)移酶樣蛋白27是結(jié)腸癌預后的生物標志物并與免疫浸潤相關(guān)

2022-05-06 07:19:40鄧牧文劇永樂歐陽滿照
南方醫(yī)科大學學報 2022年4期
關(guān)鍵詞:結(jié)腸癌數(shù)據(jù)庫分析

結(jié)腸癌是消化道常見的腫瘤之一,主要發(fā)生于腸黏膜,并向鄰近臟器擴散。雖然接受根治性切除術(shù)的早期結(jié)腸癌患者的5年生存率超過90%,但大多數(shù)患者被診斷為晚期或轉(zhuǎn)移,導致5年生存率下降到10%。目前臨床上治療結(jié)腸癌的方法主要有手術(shù)、放療、化療、靶向治療等,這些治療方法已經(jīng)取得了相當大的進展。但由于診斷晚、發(fā)展快、轉(zhuǎn)移頻率高,患者預后仍較差,遠不能令人滿意。因此,迫切需要探索結(jié)腸癌的分子機制,并確定新的生物標志物用于生存評估和靶向治療。

近年來,m6A甲基化成為腫瘤研究的熱點。隨著對m6A研究的深入,發(fā)現(xiàn)m6A修飾在腫瘤的發(fā)生及進展中發(fā)揮重要功能。隨著研究的深入,愈來愈多的m6A甲基化相關(guān)的酶被發(fā)現(xiàn)與腫瘤細胞的增殖、凋亡及侵襲、遷移相關(guān)。例如研究發(fā)現(xiàn)m6A甲基轉(zhuǎn)移酶METTL3通過直接或間接上調(diào)MYC的表達促進結(jié)直腸癌細胞的惡性增殖。在此研究背景基礎(chǔ)之上,我們發(fā)現(xiàn)了在腫瘤中差異表達的基因——METTL27(Methyltransferase Like 27)。METTL27(亦 稱WBSCR27)是屬于甲基轉(zhuǎn)移酶系列的蛋白質(zhì),現(xiàn)有研究報道METTL27 是與Williams-Beuren 綜合征相關(guān)未知功能的編碼蛋白。通過對其蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的研究發(fā)現(xiàn),可以將METTL27 歸類為I 類甲基轉(zhuǎn)移酶(MTases)。然而,目前關(guān)于METTL27的生物學功能及甲基化反應未見研究,在腫瘤中發(fā)揮的作用亦尚未見報道,在結(jié)腸癌中的作用機制仍待進一步挖掘。因此,本研究旨在通過TCGA、GEO、HPA等數(shù)據(jù)庫,應用生物信息學方法分析METTL27在結(jié)腸癌中的表達、臨床相關(guān)性及生存預后相關(guān)性。使用GSEA 富集分析挖掘METTL27可能參與的信號通路,揭示其在結(jié)腸癌中發(fā)生發(fā)展中的分子機制,希望提供一種新的候選基因來改善結(jié)腸癌的預后和生存率。……

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