健康成人口腔微生物組成及功能的宏基因組學研究

人類口腔中生長著大量的細菌、真菌、病毒和古生菌等微生物，形成了一個豐富的微生物群落，被稱為口腔微生物群，是人類體內僅次于結腸微生物群的第二復雜的微生物群落

。口腔微生物群與宿主微環境之間復雜的相互作用，維持著口腔微生態區域的動態平衡。口腔微生態一旦失衡，不僅會導致齲病

、牙周病

和口腔癌

等口腔疾病，還會引起糖尿病

、心血管疾病

、類風濕性關節炎

等全身系統性疾病。口腔微生物已經成為了探究口腔疾病及相關全身系統性疾病生物標志物的途徑，深入了解健康人群口腔微生物組的物種組成及功能基因代謝通路十分必要。

該病是氣傳病害，必須采取以種植抗病品種為主，藥劑防治和栽培措施為輔的綜合防治策略，才能有效地控制其為害。

隨著科技進步，人們對口腔微生物的研究不再局限于傳統的培養方法，而是有了一系列的高通量測序技術。比如常用的16S ribosomal DNA（16S rDNA）擴增子測序技術和宏基因組學測序技術。兩種方法相比較而言，16S rDNA 擴增子測序主要依賴于16S 基因中特定區域的測序，而選擇的這種特定區域可能代表性不足，導致生物類群分類學分析分辨率有限

。而Handelsman 等

于1998 年提出了宏基因組的概念，是指生態環境中全部微小生物遺傳信息的總和。與16S rDNA 擴增子測序不同，宏基因組測序具有較高的分辨率，可以直接獲得可培養和不可培養微生物的全部遺傳信息，不僅可以發現一些豐度較低的細菌類群，而且可以分析樣本的功能基因，從而更深入地揭示口腔微生物群落的多樣性和復雜性