基于R的食管癌預后獨立危險因素分析和列線圖建立

魏凌華 徐成振

摘要：目的：預測食管癌的預后獨立危險因素，建立食管癌患者的列線圖。方法：在SEER數據庫中篩選符合條件的食管癌患者數據，調用rms包中的cph（）函數，獲得預后獨立危險因素;根據納入的各種因素，通過調用nomogramEx包中的nomogram（）函數建立食管癌患者列線圖。結果：共納入2010年至2016年期間的6847例食管癌患者，根據Cox回歸分析發現，放療是食管癌患者預后的獨立危險因素。通過列線圖可以獲得食管癌患者的個體化的生存概率。結論：在R中可以簡單快捷的實現食管癌患者的預后獨立危險因素的分析和列線圖的建立，為不同食管癌患者提供合適的治療方式。

關鍵詞：R;食管癌;預后;危險因素;列線圖

Abstract： Objective：To predict the independent risk factors for the prognosis of esophageal cancer， and to establish the nomogram of patients with esophageal cancer.Methods：The data of patients with esophageal cancer were screened in SEER database， and the independent prognostic risk factors were obtained by calling the cph（） function in RMS package; according to the included factors， nomograms of patients with esophageal cancer were established by calling the nomograms（） function in nomogramex package.Results：A total of 6847 patients with esophageal cancer from 2010 to 2016 were included. According to Cox regression analysis， radiotherapy was an independent risk factor for the prognosis of patients with esophageal cancer. The individual survival probability of patients with esophageal cancer can be obtained by nomogram.Conclusion：In R， we can analyze the independent prognostic risk factors and establish nomogram of patients with esophageal cancer， and provide appropriate treatment for different patients with esophageal cancer.

Key words： R; esophageal cancer; prognosis; risk factors; nomogram

食管癌是一種預后較差的惡性腫瘤，在全球范圍內，食管癌的發病率位于惡性腫瘤的第六位，死亡率位于惡性腫瘤第八位[1]。雖然在過去的40年內食管癌的5年期生存率從5%提到了19%[2]，但食管癌的整體預后仍然較差，且治療后的并發癥發病率較高[3]。首先，食管癌的發病因素很多，年齡、性別、種族、飲食習慣、生活環境等均對其有影響[4]。其次，療效不是很理想，現有的治療方式很多，有外科手術、放療、化療、輔助治療以及以手術為主的綜合治療等方式，由于腫瘤的大小、位置以及患者自身的條件各不相同，采用的治療方式也不盡相同，治療的結果也不理想[5]。

由美國癌癥聯合委員會與國際抗癌聯盟制定的TNM分期系統[[6]，是目前全球應用最廣的腫瘤分期標準，目的在于了解患者所處的病程，根據病程來制定治療方案、判斷患者的預后和療效。TNM分期系統最新版本是由國際抗癌聯盟（UICC）和美國癌癥聯合會（AJCC）于2015年聯合發布的第8版[6]，由于本研究的數據取得時間是2010至2016年，因此仍采用2009年的第7版[7]，具體的TNM分期詳情見表1。

1 資料與方法

1.1 資料來源

SEER（surveillance，epidemiology and end results;監測，流行病學和最終結果）數據庫建立于1973年，由美國國家癌癥研究所（NCI）資助[8]。用于記錄患者的人口學（種族、性別、年齡、婚姻狀態）、腫瘤（病理類型、分化程度、組織學類型）、病理、治療方式（手術、放療、化療等）和預后（總體生存率、疾病特定死亡率、死亡原因）等信息。

1.2 數據的納入與排除標準

本研究的數據納入標準：（1）患者年齡在18歲至80歲;（2）患者確診時間在2010年至2016年期間;（3）患者發病為食管癌且為單原發癌。

本研究的排出標準：（1）種族中變量是Unknown的;（2）性別中有Unknown的;（3）病例組織學中分級為Unknown的;（4）發病部位不是胸段的（胸段部位：C15.3-Upper third of esophagus，C15.4-Middle third of esophagus，C15.5-Lower third of esophagus）;（5）手術中編號為99的;（6）生存時間為Unknown和0的;（7）婚姻狀態為Unknown的;（8）AJCC TNM分期中不是T1（T1，T1a，T1b，T1NOS）、T2、T3和T4（T4，T4a，T4b）期的;（9）區域淋巴結是NX、NA和Blank（s）;（10）遠處轉移狀態為NA和Blank（s）;（11）放療是None/Unknown和（Recommended， unknown if administered）的。