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河南地方綿羊品種LHR基因的多態性分析

2021-03-15 13:25:32邵俊紅付俊偉董智豪白俊艷陳夢柯付學言韓志洪崔晗晗
當代畜禽養殖業 2021年1期

邵俊紅,付俊偉,董智豪,白俊艷*,陳夢柯,付學言,冀 祥,韓志洪,崔晗晗,彭 彬

(1.河南省汝州市動物衛生監督所,河南 汝州 467500;2.河南科技大學動物科技學院,河南 洛陽 471023)

促黃體素受體 (LHR)是屬于G蛋白偶聯受體(GPCR)超家族中的糖蛋白亞家族成員,其氨基酸序列和結構有高度同源性,具有7個跨膜區、4個胞質區以及由3個環狀區和N端組成的細胞外區,細胞外區中大約有14個不完全重復的富含亮氨酸的序列。其不但有與跨膜區發生反應后介導信號傳導的特性,而且還具有結合黃體生成素 (LH)的作用。葛立軍等[1](2007)在多種動物包括靈長類動物、豬、牛、火雞以及人的子宮內都發現有促黃體素(LH)或人絨毛膜促性腺激素(HCG)及其mRNA的結合位點。狄冉等[2](2009)檢測了促黃體素受體(LHR)基因外顯子11在性早熟、高繁殖力山羊品種(濟寧青山羊)和性晚熟、低繁殖力品種(波爾山羊、安哥拉山羊和內蒙古絨山羊)中的單核苷酸多態性,結果發現,僅引物P3和P6的擴增片段具有多態性。申穎等[3](2009)在探究LHR基因在濟寧青山羊發情周期的不同階段于子宮中的表達差異時,發現LHR mRNA在整個發情周期的子宮中都有表達,但各時期表達量不同。王利紅等[4](2011)在探究綿羊促黃體素受體基因(LHR)外顯子11多態性與繁殖性能的相關性的過程中,發現設計的引物中只有兩個引物的擴增片段具有多態性。本研究將PCR-SSCP技術與測序相結合,對小尾寒羊、大尾寒羊和豫西脂尾羊的LHR基因進行種群內和種群間的多態性分析,為綿羊品種的改良和保護提供科學依據。

1 材料與方法

1.1 試驗材料

分別采集來自濮陽的小尾寒羊、來自平頂山的大尾寒羊和來自偃師烏龍村的豫西脂尾羊的血樣,各48只,采用頸部靜脈采血方法,經抗凝處理后在冰壺中低溫保存運回實驗室,血樣于-20℃條件下保存備用。

1.2 試驗方法

引物由北京鼎國昌盛生物技術有限責任公司合成。 具體為:F:5'-TCGTTTCCTCATGTGCAATCT-3';R:5'-GGTATGCCATCTTTCTAGTGTGAT-3',擴增產物片段大小為200 bp。PCR反應體系的總體積為15 μL,其中 1 uL 的 DNA,上、下游引物各為 1 μL,去離子水 4.5 μL, 以及 7.5 μL 的 2×Taq PCR Green Mix。PCR 擴增程序為:94 ℃預變性 4 min,35×(94 ℃變性 40 s,58 ℃退火 1 min,72 ℃延伸 80 s),72 ℃繼續延伸5 min,最后于4℃條件下保存。PCR產物經1%瓊脂糖電泳,在紫外投射儀中進行觀察,確定為陽性后在12%非變性聚丙烯酰胺凝膠上進行電泳。利用Excel軟件統計基因型頻率、基因頻率以及多態信息含量等相關指標。

2 結果與分析

2.1 綿羊LHR基因的瓊脂糖電泳結果

如圖1所示,通過梯度PCR得知,58℃是該引物的最適退火溫度。對該退火溫度下的PCR產物用1%瓊脂糖凝膠進行電泳檢測,結果發現特異性擴增良好,無拖尾,與預期片段大小200 bp相符,可進行SSCP分析。

圖1 綿羊 LHR基因的瓊脂糖檢測結果

2.2 綿羊LHR基因的聚丙烯酰胺凝膠電泳結果

對小尾寒羊、大尾寒羊、豫西脂尾羊促黃體素受體(LHR)外顯子11的PCR產物進行電泳,結果見圖2。可以發現,在小尾寒羊中檢測到AB、BB兩種基因型,在豫西脂尾羊中檢測到AA、AB、BB三種基因型,在大尾寒羊中檢測到AB、BB兩種基因型。

圖2 綿羊LHR基因的聚丙烯酰胺凝膠電泳圖

2.3 綿羊LHR基因的群體遺傳學分析

從表1可以看出,促黃體素受體(LHR)外顯子11在小尾寒羊、大尾寒羊和豫西脂尾羊中存在三種基因型,記為AA、BB和AB。其中小尾寒羊AA的基因型頻率為0.045,AB的基因型頻率為0.295,BB的基因型頻率為0.659。豫西脂尾羊AA基因型頻率為0.174,AB的基因型頻率為0.261,BB的基因型頻率為0.565。大尾寒羊AB基因頻率為0.098,BB基因頻率為0.902。促黃體素受體(LHR)外顯子11在小尾寒羊中的遺傳雜合度(He)為0.312,有效等位基因數(Ne)為 1.452,多態信息含量(PIC)為 0.263。在豫西脂尾羊中的遺傳雜合度 (He)為0.423,有效等位基因數(Ne)為 1.734,多態信息含量(PIC)為 0.256。在大尾寒羊中的遺傳雜合度 (He)為0.093,有效等位基因數(Ne)為 1.108,多態信息含量(PIC)為 0.089。

表1 綿羊LHR基因的群體多態性分析

2.4 綿羊LHR外顯子11的測序分析

選擇LHR外顯子11的AA、AB、BB這三種基因型的PCR產物直接測序,測序比對結果見圖3。發現不同基因型之間有5個位點發生突變,LHR在37位發生G、A的突變;在49位發生T、C的突變;在93位發生T、C突變;在139位發生T、G突變;在184位發生A、G突變。

圖3 綿羊LHR基因的不同基因型測序結果

3 討論

LHR基因是動物體內較為重要的調節因子之一,國內外許多學者都對其進行了研究。本研究采用PCR-SSCP技術分析了小尾寒羊、豫西脂尾羊和大尾寒羊LHR基因外顯子11的多態性,SSCP結果同樣檢測到了AA、AB、BB這三種基因型。此外,寸靜宇[5](2019)在探究綿羊LHR基因的多態性時發現,其所探究的LHR基因7個SNPs在大多數綿羊品種中均表現為中度多態 (0.25<PIC<0.5),且試驗中該基因的所有位點在各個綿羊品種中均處于Hardy-Weinberg平衡狀態(P>0.05)。 吳翠玲等[6](2019)在研究新吉細毛羊中5個生殖激素受體基因的多態性時發現,LHR基因存在 T1262G、A1991G、C2012T、A2032T 和 T2041A的突變,但這些突變對其產仔數并無顯著影響 (P>0.05)。關于其他物種,王愛華等[7](2003)發現,豬 LHR基因外顯子11序列發生了一個堿基突變,但并沒有造成該段蛋白序列的改變,為沉默突變。以上研究都對LHR基因的SNP位點進行了部分探索,雖與本試驗研究目的不一致,但均表明LHR基因具有較高的堿基突變概率。

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