汪雨彤 葉凡 張霄 鄒睿涵 王明遠 俞鍇 崔詩允
腫瘤發生過程中,癌基因擴增是常見的細胞改變之一。癌基因[1]和功能元件如增強子[2]的過表達,能給細胞提供選擇性生長優勢。研究[4]表明,腫瘤細胞中可攜帶癌基因的染色體外DNA(extrachromosomal DNA, ecDNA)是癌基因大量擴增的直接原因[3],可以增加腫瘤遺傳異質性。ecDNA也已被證實在腫瘤細胞中普遍存在[5],且患者攜帶ecDNA往往提示更差的預后[6]。本綜述將重點闡述ecDNA基本特征和其與腫瘤發生發展的關系。
1965年染色體外DNA被首次發現,研究人員在哺乳動物DNA樣本中觀察到大小不一的DNA圓環,大的圓環常兩兩成對,故被稱為雙微鐘(double minutes, DMs)[7,8]。使用現代技術研究表明,DMs存在于各種類型的癌細胞中[9,10],并含有原癌基因[5,11-14]。它的基本特征是一種在光學顯微鏡下可見的大型的(1 Mb-3 Mb或以上)、具有一個或多個完整基因和調控區的環狀DNA,并且缺乏著絲粒或端粒。且進一步研究[5]發現,腫瘤細胞中只有約30%的染色體外DNA是成對的DMs,故現在多將雙微鐘及其單體形式稱為ecDNA,不再用曾經的DMs描述它們。
廣義的染色體外DNA大小不一,從幾百堿基對的microDNA[15]到幾百kb的DMs[11],廣泛存在于秀麗隱桿線蟲、酵母、果蠅、小鼠、人體正常細胞和癌細胞等多種生物體內[16-22],一般被稱為染色體外環狀DNA(extrachromosomal circular DNA, eccDNA),不是本文的主要討論重點。ecDNA屬于eccDNA的一種,但eccDNA廣泛存在,而ecDNA多見于腫瘤細胞內。
ecDNA的存在在癌癥中很常見。對來自不同患者的腫瘤細胞系和永生非癌細胞系等進行量化ecDNA水平研究發現,ecDNA幾乎不存在于正常細胞中,但在40%的各類型癌癥細胞和90%患者腦部腫瘤移植模型中存在。……