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基于生物信息學分析PKM2在肺腺癌中的表達及臨床意義*

2020-12-03 06:49:38張軼賈方王秋月崔文靜王菊勇
腫瘤預防與治療 2020年9期
關鍵詞:肺癌數(shù)據(jù)庫分析

張軼,賈方,王秋月,崔文靜,王菊勇

200032 上海,上海中醫(yī)藥大學附屬龍華醫(yī)院 腫瘤研究所

肺癌作為嚴重威脅人類健康的主要公共衛(wèi)生問題之一,2018年全球新發(fā)病例約209萬例,死亡約180萬例,在我國肺癌的發(fā)病與死亡人數(shù)均居惡性腫瘤首位[1-2]。隨著分子診斷技術的發(fā)展,早期發(fā)現(xiàn)、診斷并接受治療已成為降低肺癌死亡率、延長患者生存期的關鍵措施。肺癌中最常見的病理類型為肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD),因其早期臨床癥狀不明顯,明確診斷時已屬中晚期,5年生存率不足17%[3-4]。因而從分子水平探尋影響LUAD發(fā)生發(fā)展及預后生存的新靶點具有重要意義。

惡性腫瘤代謝重編程的主要表現(xiàn)為有氧糖酵解,這種即使在氧氣充足的條件下仍以糖酵解為首要產(chǎn)能途徑的代謝方式在腫瘤細胞的快速生長中起著至關重要的作用。M2型丙酮酸激酶(pyruvate kinase M2,PKM2)是一種在糖酵解后期過程中起主要作用的限速酶,可催化磷酸烯醇式丙酮酸生成丙酮酸并釋放能量[5],在調(diào)節(jié)細胞代謝活動和腫瘤生長中起著關鍵作用[6]。臨床研究表明,多種類型癌癥的不良預后與PKM2過表達相關,PKM2被認為是肺、胃腸道、卵巢、皮膚、腎和膽管等惡性腫瘤的潛在診斷標志物[7-8]。有研究指出,敲除PKM2可抑制人類非小細胞肺癌的發(fā)生并促進凋亡[9],但目前尚無針對其在LUAD中的臨床預后和生物學過程的系統(tǒng)分析。

本研究采用生物信息學的方法,聯(lián)合基因表達數(shù)據(jù)庫(Gene Expression Omnibus,GEO)、癌癥基因組圖譜(The Cancer Genome Atlas,TCGA)和人類蛋白質(zhì)表達圖譜(Human Protein Atlas,HPA)等癌癥公共數(shù)據(jù)庫,分析PKM2在LUAD中的表達情況及其潛在的臨床預后意義,為進一步探究LUAD發(fā)生的分子機制和治療靶點提供新思路。……

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