張悅,馮穎,馬芳,3
早期停育胚胎的滋養(yǎng)層細(xì)胞相關(guān)基因與特征分析
張悅1,馮穎2,馬芳1,3
1. 四川大學(xué)華西第二醫(yī)院教育部“婦兒疾病與出生缺陷”重點實驗室,成都 610041 2. 四川大學(xué)華西基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與法醫(yī)學(xué)院,成都 610041 3. 四川大學(xué)華西第二醫(yī)院婦產(chǎn)科,成都 610041
滋養(yǎng)層細(xì)胞對維持正常胚胎植入、生長發(fā)育有重要作用。研究停育胚胎的滋養(yǎng)層細(xì)胞的基因表達(dá)差異有助于了解胚胎發(fā)育停止或不良妊娠結(jié)局的發(fā)生發(fā)展機制。本研究通過對26例正常妊娠、胚胎停育婦女的絨毛組織進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組測序和初步生物信息學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)胚胎停育組存在436個差異基因,其中406個mRNA為顯著上調(diào)基因,32個mRNA為顯著下調(diào)基因。基因富集分析顯示這些基因顯著富集于免疫相關(guān)功能、細(xì)胞間黏附等方面,如淋巴細(xì)胞激活、髓系細(xì)胞激活、細(xì)胞外基質(zhì)及膠原連接等,其潛在調(diào)控通路富集到補體及凝血級聯(lián)反應(yīng)和細(xì)胞外基質(zhì)降解等條目。此外,本研究利用WGCNA共表達(dá)分析得到和差異基因存在共表達(dá)關(guān)系的lncRNA。根據(jù)模塊功能不同,繪制了兩個網(wǎng)絡(luò)圖,可得4個關(guān)鍵基因,分別為和。本研究得到的這些差異基因可作為對胚胎停育具有潛在影響的關(guān)鍵分子,所富集到的條目可為深入了解胚胎發(fā)育停止或不良妊娠結(jié)局的病因及機制提供理論依據(jù)及方向。
滋養(yǎng)層細(xì)胞;RNA測序;富集分析;基因特征
早期絨毛組織的細(xì)胞構(gòu)成主要指滋養(yǎng)層細(xì)胞(trophoblast)[1]。根據(jù)細(xì)胞功能及形態(tài)的特點,滋養(yǎng)層細(xì)胞可分為細(xì)胞滋養(yǎng)層、合體滋養(yǎng)層和絨毛外滋養(yǎng)層細(xì)胞。……