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線葉龍膽(Gentiana lawrencei var. farreri)ITS序列雜合性與遺傳分化分析

2020-10-20 02:25:42付鵬程林清銀孫姍姍
生物學雜志 2020年5期

付鵬程, 林清銀, 孫姍姍

(洛陽師范學院 生命科學學院, 洛陽 471934)

龍膽屬植物是典型的高山植物,以青藏高原及其周邊地區為分布中心和分化中心[1-2]。線葉龍膽(Gentianalawrenceivar.farreriT. N. Ho)是龍膽屬多枝組中的常見物種,多年生草本,是青藏高原特有植物,也是高山草甸的重要組成部分。線葉龍膽可用于醫藥,具有較高的藥用價值;同時其花色素雅,形態優美,也具有較高的園藝觀賞價值。已有的進化研究表明,線葉龍膽的葉綠體基因組存在ndh基因缺失[3];基于葉綠體片段和微衛星標記的群體研究表明,該物種目前的遺傳格局受到了冰川運動及環境氣候變化的顯著影響[4]。

ITS序列(Nuclear ribosomal internal transcribed spacer)是核糖體RNA 18S、5.8S和25S的間區序列,分別為ITS1和ITS2,其中ITS1-5.8S-ITS2序列是進化生物學中常用的分子標記之一[5-6]。相較于葉綠體或線粒體的單親遺傳,ITS序列位于細胞核,遵循雙親遺傳規律,在揭示種間雜交等復雜進化過程中具有重要作用。由于ITS位點的通用引物在不同物種中均易于擴增,且其基因間區的序列變異較大,是重要的barcoding標記之一[5],能較好地反映種間系統發育關系。ITS序列在物種居群內往往也存在較豐富的變異,可用于群體遺傳學研究[7-8]。然而,由于ITS序列常存在雜合現象,經PCR擴增后直接Sanger法測序的結果常出現套峰或亂峰,導致無法準確獲取部分物種的序列。

本研究以線葉龍膽的7個居群為研究對象,通過對部分個體進行基因克隆與測序,探討線葉龍膽ITS序列的基本特征及其遺傳分化,研究結果將為龍膽屬植物的進化研究提供參考。……

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