錢國清
綜 述
慢性阻塞性肺疾病全基因組關聯研究進展
錢國清1,2,3
1. 寧波大學附屬寧波市第一醫院內科,寧波 315010 2. 浙江大學寧波醫院呼吸科,寧波 315010 3. 英國諾丁漢大學醫學院,諾丁漢 NG7 2RD
慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease, COPD)是一種以不完全可逆的氣流受限為主要特征的慢性氣道炎癥,是一種由遺傳因素和環境因素共同作用的復雜疾病,也是世界主要致死疾病之一。近年來,隨著全基因組關聯研究(genome-wide association study, GWAS)的不斷深入,研究者們發現了大量與肺功能或COPD相關的遺傳變異或基因位點、藥物靶點等。本文綜述了2007年以來世界范圍內針對肺功能或COPD的GWAS方面的研究工作及其進展綜述,分析了可能存在的藥物靶點,并探討了COPD在全基因組關聯研究中面臨的挑戰和困難,為深入研究COPD發病機制提供新思路。
慢性阻塞性肺疾病;肺功能;全基因組關聯研究;遺傳變異;基因座;易感基因;致病基因
慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmo-nary disease, COPD)是一種以氣流受限為主要特征的慢性氣道炎癥。肺功能檢查可評估COPD氣流受限程度,當吸入支氣管擴張劑后,第一秒用力呼氣容積(forced expiratory volume in one second, FEV1)和用力肺活量(forced vital capacity, FVC)之間比值<0.7表明存在持續氣流受限,排除其他疾病后,可確診COPD。因此,肺功能是診斷COPD的金標準[1]。據報道我國40歲以上人群COPD患病率高達13.7%,總人數近1億[2]。2015年,全球預計有320萬人死于COPD,其中中國有100多萬[3];根據世界衛生組織預測,至2020年COPD將成為全球第3大致死疾病[4]。吸煙、空氣污染、職業暴露等多種因素均可導致COPD,其中吸煙患者僅有10%~20%發展成為COPD[5],然而25%的COPD患者終生不吸煙[6],因此表明,COPD是遺傳因素與環境因素共同作用的結果。近年,隨著全基因組關聯研究(genome-wide association study, GWAS)在肺功能和COPD中的應用,發現了大量易感基因(susceptibility gene)或基因座(locus),為進一步闡述COPD的發病機制提供了全新的思路。
GWAS研究是在一定人群中選擇病例組和對照組,基于單核苷酸多態性(single nucleotide polymor-phism, SNP)作為分子遺傳標記,比較全基因組范圍內所有SNP位點的等位基因或基因型頻率在病例組和對照組間的差異;然后,利用連鎖不平衡關系推測可能的疾病或性狀的易感基因或區域,從而尋找與疾病發生相關的致病位點。隨著人類基因組計劃和基于SNP的國際人類單體型圖譜(HapMap)構建完成,GWAS得以實現并被廣泛應運于糖尿病、精神分裂癥和哮喘等疾病[7,8]。……