劉倩,李春燕,2
綜 述
增強子的鑒定及其在腫瘤研究中的應(yīng)用
劉倩1,李春燕1,2
1. 北京航空航天大學(xué),大數(shù)據(jù)精準(zhǔn)醫(yī)療高精尖創(chuàng)新中心和醫(yī)學(xué)科學(xué)與工程學(xué)院,北京 100191 2. 工業(yè)和信息化部大數(shù)據(jù)精準(zhǔn)醫(yī)療重點實驗室(北京航空航天大學(xué)),北京 100191
增強子是一類增強靶基因轉(zhuǎn)錄活性的DNA順式作用元件。但是增強子與靶基因的方向和距離不確定,大大增加了研究增強子調(diào)控的靶基因及其作用機(jī)制的困難。已有大量研究顯示,增強子的突變或功能異常與疾病發(fā)生發(fā)展相關(guān);僅有少量研究報道增強子通過促進(jìn)靶基因的表達(dá),引發(fā)癌癥或產(chǎn)生抗藥性。目前與癌癥發(fā)生發(fā)展和在癌癥治療過程中抗藥性產(chǎn)生相關(guān)的增強子尚未得到充分鑒定,這些增強子的調(diào)控機(jī)制也未得到充分解析。本文對目前可在全基因組水平上預(yù)測和鑒定增強子以及解析增強子調(diào)控機(jī)制的方法進(jìn)行總結(jié)和對比,并對近幾年增強子在腫瘤診斷、治療和發(fā)生發(fā)展機(jī)制中的研究進(jìn)展進(jìn)行綜述。期望本文為篩選與癌癥發(fā)生發(fā)展相關(guān)的增強子和解析這些增強子的調(diào)控機(jī)制提供參考,為提高癌癥的診斷和制定癌癥的治療策略提供新的視角。
增強子;超級增強子;鑒定;腫瘤
增強子是一種通過與靶基因啟動子相互作用來增強靶基因轉(zhuǎn)錄的DNA調(diào)控元件。增強子與調(diào)控的靶基因的位置不確定,有些位于靶基因的5?端,有些位于靶基因的3?端,甚至位于基因的內(nèi)含子中。增強子與靶基因的距離也不確定,甚至遠(yuǎn)離靶基因達(dá)幾 Mb仍可增強靶基因的轉(zhuǎn)錄。……