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高齡女性卵泡液中差異表達蛋白質(zhì)篩選及其生物信息學分析

2020-08-05 05:30:34孫金龍郭瓊相珊趙帥連方
山東醫(yī)藥 2020年20期
關鍵詞:差異分析

孫金龍,郭瓊,相珊,趙帥,連方

1 山東中醫(yī)藥大學附屬醫(yī)院,濟南250011;2 山東省婦幼保健院;3 山東中醫(yī)藥大學

年齡是女性卵巢功能的決定性因素[1],而卵巢功能減退是高齡女性面臨的一個重要不孕因素。目前,臨床上許多要求生育的高齡女性與晚婚晚育、高齡失獨等有關。因此,明確高齡女性卵巢功能衰退的生物學基礎,具有重要的現(xiàn)實意義。卵巢功能衰退不是單一、獨立的事件,與人體衰老一樣,也是多系統(tǒng)、多途徑、多環(huán)節(jié)的整體變化[2,3],而蛋白質(zhì)組學研究最能體現(xiàn)這種整體性。本研究通過蛋白質(zhì)組學篩選高齡婦女卵泡液差異表達蛋白質(zhì)并對其進行生物信息分析,以探討女性隨年齡增大卵巢功能衰退的生物學基礎。

1 資料與方法

1.1 臨床資料 經(jīng)山東中醫(yī)藥大學附屬醫(yī)院醫(yī)學倫理委員會批準,選取2017年12月~2018年12月于我院擬行輔助生殖技術助孕的女性患者。納入標準:①年齡21~42歲;②因男方精子數(shù)量和活力不足而導致女性不孕;③簽署相關的知情同意書。排除標準:①卵巢早衰;②合并子宮內(nèi)膜異位癥、子宮腺肌病、卵巢腫瘤、多囊卵巢綜合征、盆腔炎性疾病等;③合并影響卵巢功能的其他系統(tǒng)疾病。共收集女性不孕患者100例,根據(jù)年齡將其分為高齡組(年齡≥35歲)和非高齡組(年齡﹤35歲)各50例。高齡組年齡(37.48±2.08)歲,啟動日血清人抗繆勒管激素(AMH)水平(3.37±1.46)ng/mL,雙側(cè)卵巢竇卵泡數(shù)(8.70±2.31)個;非高齡組年齡(29.22±2.84)歲,血清AMH水平(7.55±2.73)ng/mL,雙側(cè)卵巢竇卵泡數(shù)(12.68±3.62)個。高齡組年齡高于非高齡組,而血清AMH、雙側(cè)卵巢竇卵泡數(shù)均低于非高齡組(P均<0.05)。

1.2 IVF與卵泡液的獲取 兩組均給予促性腺激素釋放激素(GnRH)拮抗劑方案進行促排卵,以基因重組人促卵泡激素150~250 U啟動,啟動第5天使用GnRH拮抗劑0.25 μg/d直至扳機日,促卵泡激素用藥時間11~14 d;在主導卵泡群直徑達1.8~2.0 cm時,常規(guī)取卵并收集卵泡液;將卵泡液以3 000 r/min離心l0 min,吸取上清部分置入EP管并編號,-80 ℃冰箱內(nèi)凍存。

1.3 卵泡液中差異表達蛋白質(zhì)篩選與鑒定 采用液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜法(LC-MS/MS)。復蘇卵泡液,4 ℃下以12 000 r/min離心提取蛋白質(zhì),并以BCA法測定其濃度。吸取一部分蛋白質(zhì)溶液,用50 mmol/L碳酸氫銨及DTT調(diào)整終濃度為10 mmol/L,再以碘乙酰胺調(diào)整終濃度為50 mmol/L,常溫反應30 min,避光。將溶液以超濾管高速離心后,再次用50 mmol/L碳酸氫銨清洗;繼續(xù)使用胰蛋白酶酶解,酶解產(chǎn)物經(jīng)50 mmol/L碳酸氫銨清洗,然后經(jīng)TFA酸化、除鹽等程序后獲得蛋白質(zhì)懸液。使用冷凍干燥儀凍干蛋白質(zhì)懸液,準備LC-MS/MS檢測。LC-MS/MS檢測:液相采用90 min梯度,流速為220 nL/min,預柱用AcclaimR PepMap100 column,分析柱用AcclaimR PepMap RSLC column。使用Xcalibur2.2 SP1軟件采集質(zhì)譜數(shù)據(jù),以蛋白質(zhì)豐度比>1.67(上調(diào))以及<0.6(下調(diào))為標準篩選差異表達蛋白質(zhì)。通過蛋白質(zhì)譜搜庫軟件Proteome Discoverer搜索UniProt數(shù)據(jù)庫,檢索后形成原始raw文件。使用Maxquant1.4.0.8軟件對raw文件在uniprot_proteomes-human.fasta數(shù)據(jù)庫內(nèi)進行差異表達蛋白質(zhì)鑒定。

1.4 卵泡液中差異表達蛋白質(zhì)的生物信息學分析 通過DAVID在線分析軟件(https://david-d.ncifcrf.gov/)進行差異表達蛋白質(zhì)的基因本體論(GO)和京都基因百科全書(KEGG)富集分析,并導出分析結(jié)果。GO富集分析差異表達蛋白質(zhì)的生物進程、生物學功能、細胞組分,KEEG富集分析差異表達蛋白質(zhì)的相關信號通路。

2 結(jié)果

2.1 差異表達蛋白質(zhì)篩選結(jié)果 與非高齡組比較,高齡組卵泡液中共篩選獲得23個差異表達蛋白質(zhì),其中上調(diào)9個、下調(diào)14個。見表1。

表1 差異表達蛋白質(zhì)名稱及其表達變化

2.2 差異表達蛋白質(zhì)GO富集分析結(jié)果 在生物進程方面,差異表達蛋白質(zhì)涉及受體介導的內(nèi)吞作用、補體激活、內(nèi)肽酶活性的負調(diào)控、參與吞噬作用的Fcγ受體信號通路、免疫應答調(diào)節(jié)等。在生物學功能方面,差異表達蛋白質(zhì)的主要功能包括細胞分化、增殖、凋亡(RBP4、TIMP1、IGFBP3、TNFRSF1A、IGFBP6、HGFAC、POLE、GTF3C1、TGFβI、IGFBP7、CCDC112、SYCP2、TRAF6)以及免疫(C1R、IGHG4、Igλ5鏈I區(qū)、FCGR3A、C4A、CST3)、脂代謝(RBP4、APOB、PLTP、AZGP1)、糖代謝(RBP4、AZGP1)、凝血(F13B)等,尤其以細胞凋亡與增殖調(diào)控方面更為明顯。在細胞組分方面方面,差異表達蛋白質(zhì)主要在胞外區(qū)、胞外體、胞外空間、內(nèi)吞囊腔等發(fā)揮作用。

2.3 差異表達蛋白質(zhì)KEGG通路富集分析結(jié)果 KEGG分析顯示,差異表達蛋白質(zhì)富集于PPAR、補體和凝血級聯(lián)、吞噬、系統(tǒng)性紅斑狼瘡等信號通路。

3 討論

高齡女性隨著卵巢儲備功能下降,表現(xiàn)為竇卵泡減少及其分泌的AMH降低。本研究高齡組血清AMH、雙側(cè)卵巢竇卵泡數(shù)均低于非高齡組,與之相符。卵細胞在發(fā)育成熟各個階段依靠外界反饋調(diào)節(jié)的調(diào)控,而卵泡液正是這些調(diào)控信息的重要媒介。經(jīng)蛋白質(zhì)組學分析卵泡液的成分,能夠了解卵細胞的發(fā)育狀況和質(zhì)量。本研究對卵泡液進行蛋白質(zhì)組學分析發(fā)現(xiàn),卵泡液蛋白質(zhì)組學特征與全身整體功能具有高度一致性,即隨著年齡增大,婦女體內(nèi)能量代謝過程漸趨失調(diào),尤其表現(xiàn)在糖、脂代謝受損[4]。例如,高齡女性卵泡液中高表達的IGFBP7能阻礙胰島素發(fā)揮生物效應,引起胰島素抵抗;APOB存在于低密度脂蛋白的表面,APOB表達增多時表示體內(nèi)低密度脂蛋白水平與高密度脂蛋白比例升高[5]。本研究也發(fā)現(xiàn)了幾個差異表達的免疫和凝血相關蛋白質(zhì),因其功能比較復雜,與年齡的關系尚不明確。

差異表達蛋白質(zhì)GO及KEGG富集分析顯示,高齡女性卵泡液蛋白質(zhì)組學顯現(xiàn)出了較為明顯的細胞凋亡、增殖與分化調(diào)節(jié)方面的變化。本研究鑒定到的TIMP-1可以結(jié)合MMPs并降低其生物活性,從而抑制MMPs的凋亡效應[6]。IGF是目前研究發(fā)現(xiàn)最成熟的促進顆粒細胞增殖的因子,其高表達常反映卵細胞增殖活性增強,而IGFBP-3、IGFBP-6及IGFBP7均可以競爭性抑制IGF活性的發(fā)揮[7,8]。本研究顯示,高齡女性卵泡液中IGFBP-3、IGFBP-6、IGFBP7表達上調(diào),提示其存在凋亡效應增強。HGFAC是多種細胞類型的促分裂原,TGFβI在細胞增殖分化過程中有重要調(diào)控功能。本研究顯示,高齡女性卵泡液中HGFAC、TGFβI表達下調(diào),提示其存在增殖、分化效應的抑制。

TNF在細胞凋亡過程中起著重要作用,而TNFRSF1A與Fas相關的死亡結(jié)構(gòu)域結(jié)合可激活FADD引起細胞凋亡,TRAF6具有細胞凋亡和抑制炎癥反應的雙重作用[9,10]。本研究結(jié)果顯示,高齡女性卵泡液中TRAF6表達上調(diào),同樣也顯示出其凋亡效應的增強;而TNFRSF1A的表達下調(diào)理論上應為凋亡效應抑制,可能與促排卵激素的使用有關,其原因與意義尚待進一步研究。RBP4不僅與胰島素抵抗、糖尿病等有關,還能阻止卵細胞的減數(shù)分裂進程,使生長分化因子9和BMP15表達下調(diào)[11]。本研究中高齡女性卵泡液RBP4表達上調(diào),提示凋亡效應增強并抑制卵母細胞成熟。SYCP2是生殖細胞減數(shù)分裂過程中不可或缺的一種蛋白質(zhì)[12],CCDC112下調(diào)可以導致出現(xiàn)細胞周期的阻滯[13]。本研究中高齡女性卵泡液SYCP2、CCDC112表達下調(diào),也顯示出其增殖、分化效應抑制,阻礙卵細胞成熟,這與高齡婦女卵巢功能變化規(guī)律相符。

總之,高齡女性卵泡液蛋白質(zhì)組學代謝功能總體趨勢是細胞凋亡加劇,增殖與分化修復能力下降,從而導致卵泡凋亡加速、卵細胞質(zhì)量下降[14,15],這就使得高齡女性受孕率降低而自然流產(chǎn)率升高。目前臨床上已有大量研究表明,在高齡女性促排卵過程中,通過添加生長激素促進卵泡增殖和修復功能、改善卵細胞質(zhì)量是有效的[16~18],這也證實了本研究的結(jié)果。由于卵泡液的主要來源是血清,血清蛋白不可避免地對卵泡液蛋白具有“摻雜”影響,為了將干擾因素控制到最低,提高結(jié)果的準確性,在后續(xù)研究中除了擴大樣本量,我們考慮首先進行血清差異表達蛋白的比較,并在卵泡液差異表達蛋白比較時“屏蔽”血清差異表達蛋白,對卵泡液中微小差異表達蛋白進行放大,以最大程度保留和呈現(xiàn)女性卵巢蛋白質(zhì)組學代謝的過程。

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