基于circRNA芯片數據的肺癌生物信息學分析*

翟西華，李霞，孫秋文，白津，馬凱

221000江蘇 徐州，徐州醫科大學 醫學信息與工程學院(翟西華、馬凱)；221000江蘇 徐州，徐州醫科大學附屬醫院 腫瘤科(李霞)；221000江蘇 徐州，徐州醫科大學 醫學影像學院(孫秋文)；221000江蘇 徐州，徐州醫科大學 腫瘤防治研究所(白津)

肺癌是對人類生命威脅最大的惡性腫瘤之一。肺癌分為非小細胞肺癌和小細胞肺癌兩種[1]，其中非小細胞肺癌包括腺癌、大細胞癌和鱗狀細胞癌。近年來，盡管在肺癌的診斷、分類和治療方面的研究逐步有了新的進展，但肺癌患者的總體生存率仍然很低，晚期或轉移性肺癌患者的預后更差[2]。肺癌已成為全球公共衛生的挑戰。因此，進一步了解肺癌的分子機制，尋找新的治療靶標對于肺癌的治療非常重要[3]。

CircRNA是一類特殊的非編碼RNA，具有閉合環狀結構，類似于長鏈非編碼RNA[4]，被認為是轉錄物異常剪接產生的環狀結構中的RNA分子。越來越多的數據表明，circRNA在許多生物學過程中都可以發揮重要作用。例如：細胞增殖[5]、侵襲[6]和分化[7]。相關報道表明，circRNA在肺癌、結直腸癌及肝癌等多種腫瘤中具有重要功能。Zong等[8]研究表明，circRNA_102231在肺癌組織表達上調，并可能成為肺癌患者的潛在生物標志物和治療靶標。Yao等[9]報道在非小細胞肺癌組織中circRNA_100876表達顯著上調，并與淋巴結轉移和腫瘤分期密切相關。Wan等[10]提出circRNA-ITCH通過抑制Wnt/β-catenin途徑抑制肺癌細胞的增殖。本文利用生物信息學方法分析肺癌的circRNA表達譜芯片，對比肺癌組織與正常組織，尋找差異表達circRNA并預測其潛在靶基因，為circRNA在肺癌中的作用機制與臨床治療提供新方向。……