深圳地區柯薩奇病毒A16型分子特征分析

黃華鑫

【摘? 要】CVA16（柯薩奇病毒A16），為RNA病毒科腸道病毒屬，屬于沒有包膜單股正鏈的RNA病毒，是在EV71（腸道病毒71型）之外，導致HFMD（手足口病）疾病的一種主要病原體。鑒于此，本綜述為了將手足口病的發病率降低，以深圳地區為例，對CVA16型的分子特點展開綜述。

【關鍵詞】柯薩奇病毒;柯薩奇病毒A16;分子特征

CVA16型屬于導致皰疹性咽峽、HFMD等疾病的主要病原體，其也能夠像EV71導致心肌炎等疾病一樣，使HFMD加重，甚至會威脅到患兒的生命健康[1]。因為，對于CVA16型分子來說，VP1蛋白為中和抗原、重要免疫原性蛋白質的決定簇區域，所以，對VP1的區域深入研究，可用于此種病毒進化分析與分子分型當中[2]。本綜述，對深圳地區門診CVA16型展開研究，以掌握深圳地區CVA16型的病毒傳播動態、流行病學特點，為深圳預防控手足口病，提供科學與理論依據。

1 CAl6病毒分子的流行病學特點

近些年來，由于腸道病毒，而導致的HFMD疾病發病率，呈逐年上升趨勢，在我國一些城市，已經有局部流行情況出現。因為，深圳市屬于高人口密度、沿海、流動頻繁地區，并且兒童、嬰幼兒占比較高，所以，在深圳地區HFM的發病率較高。在對CAl6病毒分子的流行病學特點分析時，使用熒光RT-PCR方式，快速檢測，深圳地區全部HFM病例的CAl6病毒，之后選取深圳地區代表性陽性株，用于CAl6特異性的引物，以此RT-PC擴增VPl基因，將陽性擴增[3]。

2 深圳地區CVA16型分子特征

2.1 CVA16在HFMD病例中的分布

通過使用熒光RT-PGR對HFMD病例當中CVA16檢測顯示，深圳市哨點醫院門診，在2016年到2017年的HFMD陽性樣本（1399份）中，CVA16的陽性樣本共有271份。在2016年的HFMD陽性樣本共有641份，其CVA16的陽性樣本有174份，2017年共有758份HFMD陽性樣本，其中有97份CVA16陽性樣本。

2.2 CVA16在病例中的分布信息

姚相杰等[4]通過對的VP1區氨基酸、核苷酸同源性進行分析，經過實踐總結得出，在51株CVA16的病毒株中，核苷酸同源性占到88.1%至100%，氨基酸同源性占比為98.6%到100%，和原型株相比，缺失與插入無堿基。在2016年的CVA16病毒株（28株）中，核苷酸同源性是92.8%到100%，氨基酸的同源性是99.3%至100%，在2017年中，CVA16病毒株核苷酸的同源性占比為88.4%到100%，氨基酸的同源性是98.6%～到100%。在2016年中病毒株JB1416300413、JB1416300399、JB1416300398和2017年的病毒株核苷酸的同源性是100%。

2.3 分析CVA16遺傳進化情況

按照核苷酸的序列，使用軟件，使用模型、方式，創建51株病毒株，和各個基因型的代表株系統發生樹。實踐結果顯示，2016年深圳CVA16病毒株（28株）類型，都是B亞型B1b亞型，而JB1416300398株，和武漢B1b的代表化，有著十分密切的關系，JB141630375株、JB141630364株，和上海的株具有親緣的關系剩下的25株和溫州市的株、上海市的等為同一個進化分支。

2.4 區的基因分型

周健明等[5]指出，當前CVA16，VP1區的基因分型，還沒有統一的標準，當前，共有兩種常用方式進行基因分型，（1）A基因型、B基因型、C基因型，其中，C基因型能夠分成C1亞型、C2亞型、C3亞型，這一種基因分型方式，會使B基因型與基因型間的核苷酸，有著較小的差異;（2）本次研究中，所參考的方法，該種方式的基本原則是按照苷酸差異最小是15%，將其分成A基因型、B基因型。可將B基因型分成B1亞型、B2亞型，在2000年之前流程B2亞型，B1亞型在2000年之后流行，B1基因亞型，能夠分成B1c、B1b、B1b。深圳龍崗區2017年的CVA16患者中，基因型都屬于B1，同時，有共同流行B1a基因亞型、B1b基因亞型，B1b是一種具備優勢的基因亞型，同時，和深圳市，以及臨省以往流行株，存在著親緣的關系。在B1a亞型的分支序列當中，一些和我國大陸地區，以往的分離株具有同源性關系，一些和越南、泰國等臨近國家毒株存在進化的關系，這一現象可以充分說明了，CVA16具有來源多樣性的特點，這和深圳屬于重要對外窗口、移民較大城市有著一定的關系。

3 總結

在我國大多數地區，在冬季和夏季是手足口病高發季節。嬰幼兒是手足口病的高發群體，而病毒為CVA16型患者的癥狀較輕。近些年來，CVA16、EV71依舊是導致手足口病出現的一個重要病原。以上對深圳地區CVA16在HFMD分布情況展開分析，從而為幫助深圳地區，預防與治療手足口病提供科學依據。

參考文獻

[1] 王春榮，王春榮，楊國樑，等.2017年濟南市柯薩奇病毒A16型VP1基因特征分析[J].中華實驗和臨床病毒學雜志，2019，33（1）：44.

[2] 鄧紅，冀天嬌，黃永迪，等.2012～2016年新疆柯薩奇病毒A6的分子流行病學特征分析[J].病毒學報，2018，34（06）：839-843.

[3] 文婕，王鵬飛，李秀芳，等.2015年昆明市柯薩奇病毒A16型VP1區基因特征分析[J].中華疾病控制雜志，2018，22（06）：607-612.

[4] 姚相杰，王偉琪，陳龍，等.2016-2017年深圳地區柯薩奇病毒A16型分子特征分析[J].中華微生物學和免疫學雜志，2019，39（9）：652-656.

[5] 周健明，鄧義州，洪澤濤，等.深圳市龍崗區2017年手足口病病原柯薩奇病毒A16型及腸道病毒71型VP1區基因特征分析[J].實用預防醫學，2019，26（03）：371-374.